小编Eri*_*een的帖子

我正在尝试按照此pandoc示例将多个作者添加到yaml元数据块中的Rmarkdown文件.pdf将在RStudio(版本0.98.932)中生成,但没有作者信息.

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title:  'This is the title: it contains a colon'
author:
- name: Author One
  affiliation: University of Somewhere
- name: Author Two
  affiliation: University of Nowhere
date: "`r format(Sys.time(), '%d %B %Y')`"
tags: [nothing, nothingness]
abstract: |
  This is the abstract.

  It consists of two paragraphs.
output: pdf_document
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我还想更多地定制标题并添加一个副标题.可能？

在下面的最小示例中,我尝试vars在回归公式中使用字符串的值.但是,我只能将变量名称字符串("v2 + v3 + v4")传递给公式,而不是该字符串的实际含义(例如,"v2"是dat $ v2).

我知道有更好的方法来运行回归(例如lm(v1 ~ v2 + v3 + v4, data=dat)).我的情况更复杂,我想弄清楚如何在公式中使用字符串.有什么想法吗？

更新以下代码

# minimal example 
# create data frame
v1 <- rnorm(10)
v2 <- sample(c(0,1), 10, replace=TRUE)
v3 <- rnorm(10)
v4 <- rnorm(10)
dat <- cbind(v1, v2, v3, v4)
dat <- as.data.frame(dat)

# create objects of column names
c.2 <- colnames(dat)[2]
c.3 <- colnames(dat)[3]
c.4 <- colnames(dat)[4]

# shortcut to get to the type of object my full code produces
vars <- …

我正在使用带有R Markdown和knitr的xtable来生成我用\ input {}调用的.tex文件.效果很好,但我还没有弄清楚如何创建像这里显示的多列.有谁知道怎么做到这个？

到目前为止,我正在使用:

tbl <- xtable(data, align="l r r r r r")
colnames(tbl) <- c("Variable", 
                  "Mean", "Std Dev", 
                  "Mean", "Std Dev", 
                  "Difference")
caption(tbl) <- c("Table Title")
print(tbl, 
    include.rownames=FALSE,
    caption.placement="top",
    booktabs=TRUE,
    type="latex", 
    file="output.tex")

我想在每个"Mean"和"Std Dev"("治疗"和"控制")上有一个不同的分组标题.

或者,是否有更好的方法使用R Markdown/knitr自动生成表格？我不想手动编辑表格,因为报告需要自动生成.

更新: @agstudy:我是乳胶新手,但我认为这是我希望用xtable(或类似xtable)自动生成的输出:

\begin{tabular}{lrrrrr}
  \toprule
      & \multicolumn{2}{c}{Treatment} & \multicolumn{2}{c}{Control} & \\
  \cmidrule(lr){2-3} \cmidrule(lr){4-5}
  Variable & Mean & Std Dev & Mean & Std Dev & Difference \\ 
  \midrule
  var1 & 1 & 2 & 3 & 4 & 5 \\ 
  \bottomrule …

我想在我的kable表中包装长文本.下面是一个表格的简单示例,其中列文本太长,需要为表格包装以适合页面.

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title: "test"
output: pdf_document
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```{r setup, include=FALSE}
  library(knitr)
```


This is my test

```{r test, echo=FALSE}
test <- data.frame(v1=c("This is a long string. This is a long string. This is a long string. This is a long string. This is a long string.",
                        "This is a another long string. This is a another long string. This is a another long string. This is a another long string. This is a another long string."),
                   v2=c(1, 2))
kable(test)
```

我想将数据框导出到Excel并根据特定规则突出显示单元格.我不认为对类似问题的答案是正确的.我认为这是可能的,我认为我接近使用包的CellStyle功能xlsx.

下面我概述了我尝试过的内容.大多数想法来自包帮助文件.当我尝试将我创建的样式应用于符合条件的单元格时,我会一路走到最后并得到错误.我收到错误:Error in .jcall(cell, "V", "setCellStyle", cellStyle$ref) : RcallMethod: invalid object parameter.

library(xlsx)
# create data 
  cols <- sample(c(1:5), 1) # number of columns to vary to mimic this unknown
  label <- rep(paste0("label ", seq(from=1, to=10)))
  mydata <- data.frame(label)
  for (i in 1:cols) {
    mydata[,i+1] <- sample(c(1:10), 10)
  }
# exporting data.frame to excel is easy with xlsx package
  sheetname <- "mysheet"
  write.xlsx(mydata, "mydata.xlsx", sheetName=sheetname)
  file <- "mydata.xlsx"
# but we want …

我正在尝试添加本地图像并将其调整为.RmdRStudio中的文件,该文件将生成pdf.我可以轻松添加文件

![My caption.](path/file.png)

但我还没弄明白如何控制图像的大小.我尝试了带宽度属性的HTML代码,但图像不会出现(我认为只有在输出到HTML时才有效).

<img src="path/file.png" width="200px" />

我无法理解这个想法:

![My caption.](path/file.png =250x)

有没有办法修改Rmarkdown脚本来修改只有RMarkdown和基础R的本地图像的大小？

有一个建议使用png和grid包,但我的问题仅限于基础R. 但是,对于其他用户,我认为这看起来是一个很好的解决方案.

我昨天升级到了OSX Yosemite.当我运行library(xlsx)时RStudio,程序崩溃,我收到消息:"要打开'RStudio',您需要安装旧的Java SE 6运行时." 我得到有关打开相同的结果和消息R当我运行library(xlsx)在R.

这是我的详细信息:

Mac Yosemite, Version 10.10.2
R version 3.1.2 (2014-10-31) 
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)

我有Java版本8更新31.我运行java -version并收到此消息:"没有Java运行时,请求安装." 所以我安装了Java SE Development Kit 8u31.现在:

java -version
java version "1.8.0_31"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_31-b13)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.31-b07, mixed mode)

这没有做到这一点,因为运行library(xlsx)仍然会崩溃程序并发出警告.我是否需要以某种方式回滚到Java SE 6运行时,还是有办法使用我安装的最新版本？

这个SO帖子似乎是相关的,但我不清楚安装Java 6的安装解决方案.答案链接到似乎过时的苹果支持页面.

我不熟悉Java,所以我可以使用一些建议.

我正在使用RStudio,R Markdown,Latex和Pandoc来清理数据,构造变量,运行我的分析并报告结果.我对可重复研究的概念不熟悉,但我很迷恋.很有道理.

动态表格和数字都没有问题.然而,动态文本让我很难过.我可以插入内联代码来说95%的统计数据都是错误的,但我不确定如何以可重现的方式改变我的语言.

例如,如果我有一个对象x = 0.66并且我想写"3个牙医中的2个使用Crest"怎么办？我可以查看x,0.66的当前值,并在文本中键入"2 out of 3",但这是不可重现的.假设我得到新数据并重新运行我的分析,x变为0.52.我的文字已经过时了.当然,我可以动态地报告52%的牙医更喜欢Crest,但是当一切报告为百分比时,报告会变得陈旧.

我的想法是,当我想要改变写作时,我可以创建我可以在文本中调用的函数.例如,"out.of"函数可以用于if else语句来生成文本:

ifelse(x < 0.09,"fewer than 1 out of 10",
ifelse(x >= 0.09) & x < 0.11,"roughly 1 out of 10",
ifelse(x >= 0.11 & x < 0.15,"slightly more than 1 out of 10",
ifelse(x >= 0.15 & x < 0.19,"nearly 2 out of 5",
ifelse(x >= 0.19 & x < 0.21,"roughly 2 out of 5",
...
ifelse(x >= 0.95 & x < 0.99,"nearly all",
ifelse(x >= 0.99,"all","fubar"))...)

我还可以创建一个分数函数,它可以做十分之一,五分之二,三分之一......

我相信其他人已经解决了这个问题.任何线索？想法？

我正在尝试使用伟大的新包bookdown来使用RStudio中的RMarkdown创建一本gitbook风格的书.看到这里.

我的问题是关于创建自定义块.文档中有一个示例如何在CSS文件中定义块样式:

div.FOO {
  font-weight: bold;
  color: red;
} 

作者给出了一些块可能看起来像的例子.

AFAIK,没有关于如何使用图标定义此特定块的示例.我不太了解CSS,所以寻找我可以修改的东西.

我想使用像Leanpub这样的字体真棒图标来创建一些特殊的侧边栏.创建这样的东西的任何想法:

我想我需要复制fontawesome目录,指定包含的fontawesome css文件的路径(在某处,不确定在哪里),并<i>在我的div定义中使用标记,例如<i class="fa fa-comment"></i>.关于如何实现这一点并不明确......或者它是否可行.

我有这样的字符串：

string <- "1, 2, \"something, else\""

我想使用tidyr::separate_rows()with sep==","，但字符串引用部分内的逗号让我困惑。我想删除某些内容和其他内容之间的逗号（但只有这个逗号）。

这是一个更复杂的玩具示例：

string <- c("1, 2, \"something, else\"", "3, 5, \"more, more, more\"", "6, \"commas, are fun\", \"no, they are not\"")

string
#[1] "1, 2, \"something, else\""                   
#[2] "3, 5, \"more, more, more\""                  
#[3] "6, \"commas, are fun\", \"no, they are not\""

我想去掉嵌入引号内的所有逗号。期望的输出：

[1] "1, 2, \"something else\""                  
[2] "3, 5, \"more more more\""                  
[3] "6, \"commas are fun\", \"no they are not\""