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将 GENCODE ID 转换为 Ensembl - Ranged SummarizedExperiment

我有一个表达式集矩阵,其行名是我认为格式为 GENCODE ID 的格式,例如“ENSG00000000003.14”“ENSG00000000457.13”“ENSG00000000005.5”等。我想将它们转换为gene_symbol,但我不确定最好的方法,特别是因为我认为是版本“.14”或“.13”。我应该先修剪点后面的所有 ID,然后使用 biomaRt 进行转换吗?如果是这样,最有效的方法是什么?有没有更好的方法来获取gene_symbol?

非常感谢你的帮助

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