这是我需要处理的txt文件:
chr8 148401 153100 duplication
chr8 206001 207100 deletion
chr8 584401 589500 deletion
chr8 615101 616600 deletion
chr8 842601 843200 deletion
chr8 868901 869700 deletion
基本上我想提取两个数字,并做减法.我的代码如下:
#!/usr/bin/python
import os,sys
file = open('/home/xxx/sge_jobs_output/rCEU.bed','r')
for line in file.readlines():
num1 = line.split()[1].split()[0]
num2 = line.split()[1].split()[1].split()[0]
num = int(num2)-int(num1)
print num
我可以成功打印出num1; 但是num2不起作用.所以我们不能连续使用两个以上的.split？
而错误就像:
Traceback (most recent call last):
File "CNV_length_cal.py", line 8, in <module>
num2 = line.split()[1].split()[1].split()[0]
IndexError: list index out of range
这有什么不对？我对.split命令感到很困惑......但是我找不到关于那个...的教程
这些天我一直在操纵巨大的文本文件.有时我需要删除行.我的做法如下:
f=open('txt','r').readlines()
list=[]
for line in f:
if blablablabla:
list.append(line)
我知道对于大文件,.readlines()是速率限制步骤,但是.append()步骤呢？在readlines之后追加会花费多少额外的时间吗？如果是这样,也许我应该找到直接删除我不想要的行的方法,而不是追加我想要的行.
谢谢
例如,我创建了一组列表:
LIST_chr1=[]
LIST_chr2=[]
LIST_chr3=[]
...
...
现在在处理文本时,对于某一行,如果我得到"chr2",那么我需要使用LIST_chr2这样选择这个列表,我应该如何根据列表名称指向这个特定列表？
谢谢
例如，我有：
dic={'a': 1, 'b': 2, 'c': 3}
现在我想要另一个'c':4添加到字典中。它将覆盖现有的'c':3.
我怎么会dic这样：
dic={'a': 1, 'b': 2, 'c': 3, 'c':4}
传统代码运行良好，如下所示：
Map<Integer, List<Integer>> map = new HashMap<>();
if (!map.containsKey(1)) {
map.put(1, new ArrayList<>());
}
map.get(1).add(2);
现在我想尝试一下 getOrDefault 的神奇之处：
map.getOrDefault(1, new ArrayList<>()).add(2);
但是如果我使用上面的行，map.get(1)则为空。
为什么？