小编Ben*_*Lee的帖子

我正在尝试自动检测我的库是否在经典 Jupyter Notebook 或 JupyterLab 中运行。我知道get_ipython()可以告诉我我是否在内核中，但它不能告诉我我在哪个前端。

我正在尝试制作一个变分自动编码器来学习编码 DNA 序列，但遇到了意外错误。

我的数据是一组单热数组。

我遇到的问题是值错误。它告诉我我有一个四维输入，而我的输入显然是三维的 (100, 4008, 4)。

事实上，当我打印出seq图层时，它说它的形状是 (?, 100, 4008, 4)。

当我取出一个维度时，它会给我一个二维错误。

任何帮助将不胜感激！

代码是：

from keras.layers import Input 
from keras.layers.convolutional import Conv1D
from keras.layers.core import Dense, Activation, Flatten, RepeatVector, Lambda
from keras import backend as K
from keras.layers.wrappers import TimeDistributed
from keras.layers.recurrent import GRU
from keras.models import Model
from keras import objectives

from one_hot import dna_sequence_to_one_hot

from random import shuffle
import numpy as np

# take FASTA file and convert into array of vectors
seqs = …

在对我的 Python 模块进行单元测试时，我遇到了一个奇怪的错误：

\xe2\x85\x94 的构建正常通过，但其中之一无法isclose从标准math库导入。

该错误重现如下：

==================================== ERRORS ====================================\n______________________ ERROR collecting tests/test_yau.py ______________________\nImportError while importing test module \'/home/travis/build/Benjamin-Lee/squiggle/tests/test_yau.py\'.\nHint: make sure your test modules/packages have valid Python names.\nTraceback:\ntests/test_yau.py:5: in <module>\n    from math import isclose\nE   ImportError: cannot import name \'isclose\'\n!!!!!!!!!!!!!!!!!!! Interrupted: 1 errors during collection !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!\n=========================== 1 error in 0.29 seconds ============================\nThe command "pytest --cov=squiggle" exited with 2.\n

在同一目录中没有指定的文件math.py（或者在我的包中根本没有）。可能是什么原因造成的？

多次重新启动构建并没有修复这个错误，它只出现在 Python 3.4 中。

完整日志可在此处访问。