小编Don*_*oni的帖子

我正在研究一个python项目,在那里我研究RNA结构演化(例如表示为字符串:"(((...)))"其中括号代表碱基对.关键是我有一个理想的结构和一个向理想结构发展的人口.我实现了一切,但是我想添加一个功能,我可以获得"桶数",即每代人口中最具代表性的k结构.

我在考虑使用k-means算法,但我不确定如何将它与字符串一起使用.我找到了scipy.cluster.vq,但我不知道如何在我的情况下使用它.

谢谢!