小编Tom*_*nks的帖子

我想问一个关于 Pandas groupby 的问题。我正在使用 ipython 笔记本（python3）。

例如，有一个这样的数据框。

df1 = pd.DataFrame( { "Score" : ["A", "B", "C", "A", "B", "A"] ,"Class":
["Physics", "Science", "Chemistry", "Biology", "History", "English"] } )

然后，我想与 Score 进行分组。

df1.groupby("Score")

我需要这个的输出文件，我尝试过

df1.groupby("Score").to_csv("Score.txt",sep="\t")

但这不起作用。有谁知道如何制作输出文件？

我正在使用Pandas并希望从多个数据帧中提取值.例如,有三个数据帧,如下所示.

df1 = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1'],
                     'A': ['A0', 'A1'],
                     'B': ['B0', 'B1']})

df2 = pd.DataFrame({'key': ['K1', 'K22'],
                      'C': ['C1', 'C3'],
                      'D': ['D1', 'D3']})

df3 = pd.DataFrame({'key': ['K1', 'K30'],
                      'E': ['E1', 'E3'],
                      'F': ['F1', 'F3']})

如果在数据帧之间共享密钥,我想提取值.所以我在下面做了

pd.merge(df1,df2, on='key')

这显示如下,这很好.

    A   B key   C   D
0  A1  B1  K1  C1  D1

但是,如果我尝试超过2个数据帧,它将无法正常工作.例如,以下不起作用.

pd.merge(df1,df2,df3, on='key')

我认为pd.merge不适合这个.有谁知道这样做的好方法？

谢谢!

我有 DNA 序列数据。例如，

X="ACGGGT"
Y="ACGGT"

我想知道对齐分数，因此我使用了biopythonpairwise2函数。例如，

from Bio import pairwise2
from Bio.pairwise2 import format_alignment

alignments = pairwise2.align.globalxx(X, Y)
for a in alignments:
    print(format_alignment(*a))

这成功地显示了 DNA 比对，但我只需要如下的分数。有没有办法只显示分数？

我使用了biopython，但如果有更好的方法，我们将不胜感激。