我正在尝试使用IBM XL编译器在Blue Gene Q上编译软件,我收到以下错误消息:
"iostreams/zlib.cpp", line 19.10: 1540-0836 (S) The #include file "zlib.h" is not found.
make[3]: *** [zlib.o] Error 1
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我已经安装的zlib的新版本和更新的LD_LIBRARY_PATH用$HOME/zlib/include
我错过了什么吗?
我有一个巨大的字符串:
ABCDEFGHIJKLM ...
我想以这种方式将其拆分为长度为5的子串:
> 1
ABCDE
> 2
BCDEF
> 3
CDEFG[...]
UPDATE
解决方案:
好的,多亏你们,我能够找到快速做到这一点的方法!这是我的解决方案,结合了这里的一些想法:
str ="ABCDEFGHIJKLMNOP"
splitfive(){echo $ 1 | cut -c $ 2- | sed -r's /(.{5})/\1 \n/g'; }
为(第(i = 0; I <= 5;我++)); splitfive"$ str"$ i; 完成| grep -v"^ $"
我正在尝试本地编译使用openmpi(1.6.3)的软件,但是我收到了这个错误:
restraint_camshift2.o :(.toc + 0x98):未定义的引用`ompi_mpi_cxx_op_intercept'
restraint_camshift2.o:在函数`Intracomm'中:
/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25:未定义的引用`MPI :: Comm :: Comm()'
/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25:对
MPI::Comm::Comm()' restraint_camshift2.o: In functionIntracomm的未定义引用':/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm_inln.h:23:对
MPI::Comm::Comm()' restraint_camshift2.o: In functionIntracomm的未定义引用':/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25:未定义的引用`MPI :: Comm :: Comm()'
/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25:未定义的引用`MPI :: Comm :: Comm()'
restraint_camshift2.o:/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25:对MPI :: Comm :: Comm()的更多未定义引用遵循restraint_camshift2的.o :( data.rel.ro._ZTVN3MPI3WinE [_ZTVN3MPI3WinE] + 0x48):
未定义引用`MPI :: Win :: Free()'restraint_camshift2.o :(.data.rel.ro._ZTVN3MPI8DatatypeE [_ZTVN3MPI8DatatypeE] + 0x78):
未定义的引用`MPI :: Datatype :: Free()'collect2:error:ld
返回1退出状态make [3]:* [mdrun]错误1 make [3]:离开
目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src/kernel'make [2]:* [all-recursive]错误1
make [2]:离开目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src'
make [1]:* [all]错误2
make [1]:离开目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src'
make:* [all-recursive]错误1
我正在使用gcc 4.7.3任何想法或建议?谢谢!最好, …
你知道如何在python,R(Bioconductor)中实现HMM的任何好的文献和/或教程吗?(特别是用于序列分析)
compilation ×2
bash ×1
bioconductor ×1
mpi ×1
openmpi ×1
python ×1
r ×1
shell ×1
string ×1
zlib ×1