小编Mar*_*l M的帖子

我正在使用它seaborn clustermap创建集群,在视觉上它工作得很好(这个例子产生非常相似的结果).

但是,我无法弄清楚如何以编程方式提取集群.例如,在示例链接中,我怎么能发现1-1 rh,1-1 lh,5-1 rh,5-1 lh是一个很好的聚类？视觉上很容易.我正在尝试使用查看数据和树形图的方法,但我收效甚微

从示例编辑代码:

import pandas as pd
import seaborn as sns
sns.set(font="monospace")

df = sns.load_dataset("brain_networks", header=[0, 1, 2], index_col=0)
used_networks = [1, 5, 6, 7, 8, 11, 12, 13, 16, 17]
used_columns = (df.columns.get_level_values("network")
                          .astype(int)
                          .isin(used_networks))
df = df.loc[:, used_columns]

network_pal = sns.cubehelix_palette(len(used_networks),
                                    light=.9, dark=.1, reverse=True,
                                    start=1, rot=-2)
network_lut = dict(zip(map(str, used_networks), network_pal))

networks = df.columns.get_level_values("network")
network_colors = pd.Series(networks).map(network_lut)

cmap = sns.diverging_palette(h_neg=210, h_pos=350, s=90, l=30, as_cmap=True)

result = sns.clustermap(df.corr(), …

我想强制执行在 pytest 中没有测试需要超过 3 秒。

pytest-timeout ( https://pypi.python.org/pypi/pytest-timeout ) 几乎可以做我想要的......但它似乎允许我设置全局超时（即确保测试套件少于10 分钟）或者，能够在每个测试中手动设置装饰器。

期望的行为： 使用单个设置配置 pytest 以使任何超过 3 秒的单个测试失败。