我非常努力地寻找这个问题的答案,如果它是重复的,我深表歉意。
我将制作一些虚拟数据来解释我的问题。
tibble(a=c(0.1, 0.2, 0.3), sample1 = c(0, 1, 1), sample2 = c(1, 1, 0))
# A tibble: 3 x 3
a sample1 sample2
<dbl> <dbl> <dbl>
1 0.1 0 1
2 0.2 1 1
3 0.3 1 0
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如何有条件地更改Sample1和Sample2列中的值,以便如果它们等于 1,则它们采用a的值。
生成的 tibble 应该如下所示:
# A tibble: 3 x 3
a sample1 sample2
<dbl> <dbl> <dbl>
1 0.1 0 0.1
2 0.2 0.2 0.2
3 0.3 0.3 0
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理想情况下,我不想对每个单独的示例列执行此操作(我有 >100 个示例列),因此循环列的方法会更好(尽管我知道循环是魔鬼)。
感谢您的帮助!
我希望这不是重复的,但我不能在互联网上搜索更长的时间。我真的很想生成一个热图,但颜色条要在对数刻度上。我不一定要将我的值转换为日志,而是更改颜色条,使其从0, 0.01, 0.1, 1, 10, 100. 我包含了一个 reprex,它显示了我正在使用的数据示例,下面是我希望重述的论文中的一个数字。
library(tidyverse)
my_data <- tibble(sample_name = rep(c("A", "B", "C"), 3),
sample_genus = c(rep("Genus1", 3), rep("Genus2", 3),rep("Genus3", 3)),
sample_abundance = c(0,5,45,0.3,0.01,15,1,8,89))
ggplot(data = my_data, aes(x = sample_name,
y = sample_genus,
fill = sample_abundance)) +
geom_tile() +
scale_fill_viridis_c(limits = c(0, 100))
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由reprex 包(v0.3.0)于 2019 年 8 月 16 日创建