小编Nie*_*ein的帖子

到目前为止,如果我想知道迭代器中有多少次迭代(在我的情况下,文件中有多少蛋白质序列)我做了:

count = 0
for stuff in iterator:
    count += 1
print count

但是,我想将迭代器分成两半,所以我需要知道迭代的总量.有没有办法知道没有循环遍历迭代器的迭代量？

我正在尝试编译一个我从别人那里得到的c ++程序.它是在windows上开发的,g ++给出了一些编译错误.其中一个是

#include <random>

这给出了以下错误:CandidateSolution.cpp:2:18: error: random: No such file or directory.我试图找到我从哪里可以得到error.h文件,但我找不到它.我怎样才能让它发挥作用？

我有一个python脚本,它可以创建一个GUI.当在此GUI中按下"运行"按钮时,它会从导入的包(我制作)中运行一个函数

from predictmiP import predictor
class MiPFrame(wx.Frame):
    [...]
    def runmiP(self, event):
         predictor.runPrediction(self.uploadProtInterestField.GetValue(), self.uploadAllProteinsField.GetValue(), self.uploadPfamTextField.GetValue(), \
                   self.edit_eval_all.Value, self.edit_eval_small.Value, self.saveOutputField)

当我直接从python运行GUI时,它运行良好,程序写入一个输出文件.然而,当我进入应用程序时,GUI启动,但是当我按下按钮时没有任何反应.predictmiP确实包含在build/bdist.macosx-10.3-fat/python2.7-standalone/app/collect /中,就像我正在使用的所有其他导入一样(虽然它是空的,但是和所有其他导入一样我有).

如何获取多个python文件,或导入的包与py2app一起使用？

我的setup.py:

msgstr"""这是py2applet生成的setup.py脚本

用法:python setup.py py2app"""

from setuptools import setup

APP = ['mip3.py']
DATA_FILES = []
OPTIONS = {'argv_emulation': True}

setup(
    app=APP,
    data_files=DATA_FILES,
    options={'py2app': OPTIONS},
    setup_requires=['py2app'],
)

编辑:

它看起来很有效,但它只能起作用.从我的GUI我打电话

 blast.makeBLASTdb(self.uploadAllProteinsField.GetValue(), 'allDB')

 # to test if it's working
 dlg = wx.MessageDialog( self, "werkt"+self.saveOutputField, "werkt", wx.OK)
 dlg.ShowModal() # Show it
 dlg.Destroy() # finally destroy it when finished.

blast.makeBLASTdb看起来像这样:

def makeBLASTdb(proteins_file, database_name):  
    subprocess.call(['/.'+os.path.realpath(__file__).rstrip(__file__.split('/')[-1])+'blast/makeblastdb', …

我想从屏蔽数组中删除列，其中列中的每个值都被屏蔽。所以在下面的例子中：

>>> import numpy as np
>>> test = np.array([[1,0,0],[0,3,0],[1,4,0]])
>>> test = np.ma.masked_equal(test,0)
>>> test
[[1 -- --]
[-- 3  --]
[1  4  --]],
>>> np.somefunction(test)
[[1  --]
 [-- 3 ]
 [1  4 ]]

np.somefunction() 应该是什么来获得给定的输出？

我正在尝试使用Mathematica找到最小的跨越树,我想使用Combinatorica中的MinimumSpanningTree函数.我正在使用以下代码.

Needs["Combinatorica`"] 
MinimumSpanningTree[GraphPlot[m]]

其中m是矩阵.但是,MinimumSpanningTree变为红色并且不起作用.输出给出

out = MinimumSpanningTree[<maximum spanned tree>]  //can't show the tree here

如何使MinimumSpanningTree工作？它为什么变成红色？

我正在研究远程桌面服务器,Windows XP Profesional.大约2小时前,numpy还在那里工作.我试图使用for循环使用mulitprocessing.Pool()并且我一定做错了,因为在很短的时间之后运行了100个python.exe进程.我花了一些时间重新进入服务器,我想测试为什么所有这些进程都已完成.但是,我遇到了以下错误:

>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\__init__.py", line 154, in <module>
    import add_newdocs
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\add_newdocs.py", line 9, in <module>

    from numpy.lib import add_newdoc
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\lib\__init__.py", line 4, in <module
>
    from type_check import *
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\lib\type_check.py", line 8, in <modu
le>
    import numpy.core.numeric as _nx
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\core\__init__.py", line 45, in <modu
le>
    from numpy.testing import Tester
  File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\testing\__init__.py", line 8, in <mo
dule>
    from unittest import …

我有一个数据框df，我想为其制作一些行的直方图。我可以选择行并df["row1",]得到（显示 114 列中的 4 列）：

     X3432_re  X232_fa  X212_lf  X634_fv
row1 5.1       4.3      3.7      3.7

但是，当我尝试时hist(df["row1",])，我收到'x' must be numeric错误。我尝试过hist(as.vector(df["row1",]))但遇到了同样的问题。如何制作数据帧行的直方图？

我有一个test.sh通过文本文件 awks 的文件test.bed：

1   31  431
1   14  1234
1   54  134
2   435 314
2   314 414

和

while read line;do
    echo $line  
    # ... more code ... #
done < <(awk -F '\t' '$1 == 1 {print $0}' test.bed )

用bash test.sh作品运行它，但sh test.sh它会产生语法错误。我怎么能用sh而不是做上面的事情bash？

它给出的错误是

test.sh: line 5: syntax error near unexpected token `<'
test.sh: line 5: `done < <(awk -F '\t' '$1 == 1 {print $0}' …

我有一个用 VennDiagram 包制作的维恩图。数字超过100,000。

我希望中间的数字是 150,001，用逗号分隔，或者 150,000，中间有一个小空格。这可能与 VennDiagram 有关吗？

这是我的例子

library(VennDiagram)
venn.diagram(x = list(A = 1:200000,B = 50000:300000), filename = "../example.tiff") 

我想创建一个命名列表，其中每个名称都有多个值。如果每个名称都有一个值，我只能找到如何执行此操作。我现在使用的解决方案是

df <- data.frame(col1=c('a','a','b','b'), col2=c(1,2,3,4))
l <- list()
for(letter in unique(df$col1)){
  l[[letter]] <- df[df$col1==letter,]$col2
}

> l
$a
[1] 1 2
$b
[1] 3 4

但有什么更好的方法可以做到这一点？