小编use*_*599的帖子

避免在R中使用两个for循环

我有一个R代码,可以进行两个函数的卷积...

convolveSlow <- function(x, y) {  
nx <- length(x); ny <- length(y)  
xy <- numeric(nx + ny - 1)  
for(i in seq(length = nx)) {  
 xi <- x[[i]]  
        for(j in seq(length = ny)) {  
            ij <- i+j-1  
            xy[[ij]] <- xy[[ij]] + xi * y[[j]]  
        }  
    }  
    xy  
}  
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

有没有办法删除两个for循环并使代码运行得更快?

谢谢你

loops r

10
推荐指数
2
解决办法
6971
查看次数

使用.onLoad加载依赖包

我的包需要ggplot2包,但是我无法修复运行R CMD检查时得到的以下注释.

no visible global function definition for qplot
'library' or 'require' call not declared from: ggplot2
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我也有一个.onLoad函数,

.onLoad <- function(libname, pkgname){
.libPaths("~/RLibrary")
require(ggplot2)
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

有关如何解决错误的任何建议?我应该在哪里放置onLoad功能?

谢谢

r package ggplot2

2
推荐指数
1
解决办法
2687
查看次数

R CMD检查和.RDa数据文件

我在数据子目录下有.RDa格式的数据文件.但是,该R CMD check命令无法识别该load("test.RDa")命令及其在此阶段失败并发出以下错误:

Warning in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) :  
cannot open compressed file 'test.RDa', probable reason 'No such file or directory'  
Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : cannot open the connection  
Calls: load -> readChar  
Execution halted  
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

你能告诉我原因吗?我应该指定一个路径来指定从哪里加载?

r rda

1
推荐指数
1
解决办法
1775
查看次数

在R中将FASTQ ASCII转换为十进制和十六进制

我有一个FASTQ质量得分,它是一系列ASCII字符.在这种情况下(可能)ASCII字符64到126表示0到62的分数(假设它是Illumina).这产生了潜在的序列:

feffefdfbefdfffcfdeTddaYddffbfcI``S_KKX _]] MR [D_TY [VTVXQ]`Q_BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

如何提取哪个是ASCII字符的数量?

谢谢你

编辑:该序列表示由碱基构成的生物序列的质量(来自核酸中的碱基对,意指字符(ATGC)).基本质量是phred-scaled基本错误概率,等于-10 log10 Pr {base is wrong}.

ascii r fastq

0
推荐指数
1
解决办法
3038
查看次数

将PHP数组转换为Python字典格式的字符串

如何将PHP多维数组转换为Python字典格式的字符串?

var_dump($myarray);

array(2) { ["a1"]=> array(2) { ["29b"]=> string(0) "" ["29a"]=> string(0) "" } ["a2"]=> array(2) { ["29b"]=> string(0) "" ["29a"]=> string(0) "" } }
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

php python arrays dictionary function

-2
推荐指数
1
解决办法
5623
查看次数

标签 统计

r ×4

arrays ×1

ascii ×1

dictionary ×1

fastq ×1

function ×1

ggplot2 ×1

loops ×1

package ×1

php ×1

python ×1

rda ×1