目标:我的目标是在R中使用t-SNE(t分布式随机邻域嵌入)来减少我的训练数据的维数(使用N个观测值和K个变量,其中K >> N),并随后旨在得出t-我的测试数据的SNE表示.
示例:假设我的目标是将K变量减少到D = 2维(对于t-SNE ,通常,D = 2或D = 3).有两个R包:Rtsne而且tsne,我在这里使用前者.
# load packages
library(Rtsne)
# Generate Training Data: random standard normal matrix with J=400 variables and N=100 observations
x.train <- matrix(nrom(n=40000, mean=0, sd=1), nrow=100, ncol=400)
# Generate Test Data: random standard normal vector with N=1 observation for J=400 variables
x.test <- rnorm(n=400, mean=0, sd=1)
# perform t-SNE
set.seed(1)
fit.tsne <- Rtsne(X=x.train, …