小编Dol*_*ids的帖子

SLURM上的多线程

我有一个使用该Parallel::ForkManager模块分叉的Perl脚本.

据我所知,如果我分叉32个子进程并要求SLURM调度程序在4个节点上运行作业,每个节点有8个处理器,则代码将在每个核心上执行每个子进程.

我实验室的某个人说,如果我在多个节点上运行一个工作,那么其他节点就不会被使用,而且我在浪费时间和金钱.这准确吗?

如果我使用的是一个脚本,我只能使用SLURM限制一个节点?

linux parallel-processing perl fork slurm

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Python:多处理无法完成作业

我将python 2.7与multiprocessing :: Pool一起使用以并行运行作业

我简化了下面的示例,但这是它的主要要旨。

它将使用该apply_async()函数为我的字典中的每个人创建一个文件。但是,当我检查文件是否正确创建时,我注意到有时文件没有创建。

现在我想我在使用multiprocessing :: Pool的方式上做错了

有什么建议吗?

import os
from multiprocessing import Pool

def outputFile(person):
    ofh=open(person+'.txt','w')
    ofh.write('test\n')
    ofh.close()

pool = Pool(processes=4)
for person in person_dict:
    pool.apply_async(outputFile,args(person))
pool.close()
pool.join()
for person in person_dict:
    print os.path.isfile(person+'.txt')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
True
True
False
True
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

python pool multiprocessing python-multiprocessing

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在pandas.DataFrame中将np.array添加为列

我有一个熊猫数据框和一个一维的numpy nd数组。实际上,这是一个列表。

如何使用数组中的值向DataFrame添加新列?

test['preds'] = preds给出SettingWithCopyWarning 警告:

试图在DataFrame的切片副本上设置一个值。尝试改用.loc [row_indexer,col_indexer] = value

当我尝试pd.DataFrame({test,preds}),我得到TypeError: unhashable type: 'list'

python arrays numpy pandas

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Python:对多个dicts使用相同的键TypeError:'str'对象不支持项目赋值

这是我的代码

sample_fh = dir + "sampleManifest.txt"
kids = {}
fid = {}
parents = {}
status = {}
sex = {}
with open(sample_fh) as f:
    for line in f:
            line = line.rstrip('\n')
            row = line.split('\t')
            fid = row[0]
            iid = row[1]
            relation  = row[5]
            status = row[6]
            sex = row[7]
            if relation != "Mother" and relation != "Father":
                    kids[iid] = 1
                    status[iid] = status
                    fid[iid] = fid
                    sex[iid]= row[7]
            if relation == "Mother" or relation == "Father":
                    parents[(fid,relation)]  = iid …
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

python dictionary types

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