我有一个来自 20,000 帧模拟的轨迹文件,每帧之间有 5 ps 时间,我想要做的是计算二维(x 轴和 y 轴)的扩散。但是要计算二维扩散,首先我必须计算所研究分子的均方位移。MSD 计算分子在随机游走中探索系统所花费的平均时间。
我对 python 编程非常陌生,我真的希望得到一些帮助来开始这个问题并解决这个问题。希望得到积极的回应。
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