小编Kev*_*dez的帖子

我正在尝试根据Python中的全局对齐算法(或Needleman-Wunsch算法)绘制矩阵.

我不知道matplotlib是否是这种情况下最好的工具.我试图使用Bokeh,但结构很难适合我想要的矩阵.

我正在使用Bio.SeqIO(BioPython的标准序列输入/输出接口)来存储两个序列.

我得到的结果与此图像类似:

这可能在Matplotlib？我怎样才能做到这一点？

UPDATE

最后,我能够根据ImportanceOfBeingErnest给出的答案构建算法.结果如下:

以下是此实现的要点:plot_needleman_wunsch.py

这是整个项目(正在进行中):bmc-sequence-alignment