快速问题——第一次使用 biopython，我只是想根据教程快速搭建一些真正的东西。
我似乎无法Entrez.efetch()返回给定文章的网格项，唯一的方法似乎是我正在做的，即：
handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id=pmids, rettype="medline", retmode="xml")
records = Entrez.read(handle)
其中 pmids 是发布的ID列表
这将返回以下内容：http : //pastie.org/5459700
我试过根据http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25499/调整 rettype 和 retmode 参数，但没有成功。有什么明显的我失踪了吗？
$string1 = "2_0_1AU13682.0AV+0.2"
$string2 = "2_0_1AT+0.1CD13681.9"
我有这两个字符串.如何从两者中提取7个字符的十进制数？
从字符串1开始,将13682.0来自字符串2 13681.9.
十进制数始终为7个字符,始终为 xxxxx.x
我想编写一个shell脚本,它接受一个字符串作为命令行参数,并使用rev命令打印出以相反顺序输入的内容,而不是逐个反转字母.我该怎么办？所以,如果输入Flower,它将打印出rewolF
谢谢
我有一个for循环,我想每次增加0.1的变量,但是值的变化与增量不同,我不确定为什么.
我已经简化了for循环,它仍然提供了一个奇怪的输出:
for (my $t = 1000; $t < 1500 ;$t+=0.1) {
print "$t\n";
}
它打印:
1034.9
1035
1035.1
1035.2
1035.3
1035.4
1035.49999999999
1035.59999999999
1035.69999999999
1035.79999999999
1035.89999999999
1035.99999999999
1036.09999999999
1036.19999999999
1036.29999999999
[it then goes on like this to 1500]
我不知道小数位的来源.这是我对Perl的理解的问题吗？
提前致谢.
我想使用bash命令删除所有带有'*.tar.gz'扩展名的文件.我尝试了以下,但它没有用.
find . -iname '*.tar.gz' | rm
你能否建议我在这种情况下使用哪个命令？另外,请你告诉我为什么上面的命令不起作用？
我试图通过运行perl脚本来删除我的文本中的重音符号,其中我使用tr运算符(我发现的更简单的方法):
我试过了:
tr/àâäéèëêîïôöûùüç/aaaeeeeiioouuuc/;
它删除了重音,但是我得到了'aa'而不是'a','ae'而不是'e'等字符.
我有这样的日志文件:
...
h,7,0,0,0
h,8,0,0,0
h,9,1420617572,113390,9777
h,10,1420621172,546702,26577
h,11,1420621754,2746,2786
h,12,0,0,0
...
最后2列kbyte值.我需要更新所有最后2列的值kB到gB.
有关转换和列号更新的任何建议(awk,sed等)？
我使用saxon HE 9.6,它非常适合在解析格式良好的XML文件时使用XPath 3.
但我想知道如何将expath-http-client(或任何其他工作解决方案)与Saxon结合起来,以便能够解析realLife©®™(可能已损坏)的HTML.(Java不是我更好的技能).
我搜索谷歌很多小时没有任何工作解决方案.我尝试过类似的东西:
xquery_file.xsl:
xquery version "1.0";
declare namespace http="http://expath.org/ns/http-client";
let $url := 'http://stackoverflow.com'
let $response := http:send-request(
<http:request href="{$url}" method="get"/>
) return
<echo-results>
{$response}
</echo-results>
Shell命令取自expath-http-client-saxon-0.10.0的README
saxon --repo /usr/share/java/expath/repo -xsl:sample/simple-get.xsl -it:main
要么
saxon --repo /usr/share/java/expath/repo -xsl:xquery_file.xsl -it:main
没有成功.我明白了:Transformation failed: Unknown configuration property http://saxon.sf.net/feature/repo
理想情况下,我最终要做的是直接从命令行查询一个URL,而不是XQuery文件,而是一个XPath表达式(如果可能的话).我很确定那里的一些XML/Java/XPath专家有我正在寻找的解决方案.
/usr/share/java/expath/repo 包含:
/usr/share/java/expath/repo
??? expath-http-client-saxon-0.10.0
? ??? cxan.xml
? ??? expath-http-client-saxon
? ? ??? jar
? ? ? ??? expath-http-client-java.jar
? ? ? …在 Perl 中，如何找到字符串中最后一位数字的索引？
示例：Hello123xyz最后一位数字的索引是7
一个非常简单的问题(我认为)
我正在学习编辑文件 awk
我想从文件中搜索所有线条并删除所有带有醋酸纤维素的线条
我试过了
awk 'match($0,"acetate") == 0 {print $0}' filename.txt > filename.txt
但是,这会返回一个空的txt文件.
有什么建议吗？