我试图用两种不同的方法(xmlParse和httr :: GET)请求一个XML文档,并期望响应是相同的.我用xmlParse得到的响应是我所期望的但是使用httr :: GET我的请求URL在某些时候会被截断.
一个例子:
require(httr)
require(XML)
require(rvest)
term <- "alopecia areata"
request <- paste0("http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/egquery.fcgi?term=",term)
#requesting URL with XML
xml_response <- xmlParse(request)
xml_response %>%
xml_nodes(xpath = "//Result/Term") %>%
xml_text
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这应该返回
[1] "alopecia areata"
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
现在为httr
httr_response <- GET(request)
httr_content <- content(httr_response)
httr_content %>%
xml_nodes(xpath = "//Result/Term") %>%
xml_text
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这回来了
[1] "alopecia"
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
有趣的是:如果我们检查请求的URL的httr_response元素,那是正确的.只有回应是错误的.
> httr_response$request$opts$url
[1] "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/egquery.fcgi?term=alopecia areata"
> httr_response$url
[1] "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/gquery?term=alopecia&retmode=xml"
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
所以在某些时候我的查询词被截断了.如果将整个请求手动放入浏览器,则其行为与预期一致.
任何建议如何解决这个问题将不胜感激.