小编Eth*_*han的帖子

我正在尝试执行 Kolmogorov-Smirnov 检验来比较经验分布与 F 分布（我知道这些不能直接比较，但我将采用引导法）。我在 scipy KS 测试中遇到问题：

readLengths = [list,of,int,values,...]
x = stats.f.fit(readLengths)
dfn=x[0]
dfd=x[1]
stats.kstest(readLengths,stats.f.rvs(dfn,dfd,size=100))

我收到错误

TypeError: 'numpy.ndarray' object is not callable

它指向 stats.kstest 行。我认为这是 readLengths 数组的问题，但文档说它可以采用一维数组，所以不确定为什么我会遇到这个问题。另外，有趣的是，在这个函数中，您可以用“norm”命名正态分布，但“f”似乎无效，尽管它是 F 分布的 scipy 名称。

我正在尝试为 R 安装 data.table 库，但我无法让它工作。我已经尝试使用 CRAN 和 Bioconductor，但我一直收到一个错误，即该软件包不可用于 R 3.2.2：

> biocLite('data.table')
 BioC_mirror: http://bioconductor.org
 Using Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.4), R version 3.2.2.
Installing package(s) ‘data.table’
Warning: unable to access index for repository  
  https://cran.rstudio.com/src/contrib
Warning: unable to access index for repository   
https://cran.rstudio.com/src/contrib
Warning message:
package ‘datatable’ is not available (for R version 3.2.2) 
> install.packages("data.table")
Warning: unable to access index for repository     
https://cran.rstudio.com/src/contrib
Warning message:
package ‘data.table’ is not available (for R version 3.2.2) 

我真的不知道该怎么做……对 R 非常陌生。

我知道这应该很简单,但我不能让它工作.我的文件看起来像这样

>c12345|random info goes here that I want to delete
AAAAATTTTTTTTCCCC
>c45678| more | random info|  here
GGGGGGGGGGG

而我想要做的就是让它变得更加简单,所以它可能看起来像这样

>seq1 [organism=human]
AAAAATTTTTTTTCCCC
>seq2 [organism=human]
GGGGGGGGGGGG
>seq3 [organism=human]
etc....

我知道一旦我通过执行以下操作获得索引部分,我就可以轻松追加该常量:

sed '/^>/ s/$/\[organism-human]/g'

但是如何构建该索引呢？