我想创建一个描述文件资源的类,然后将其pickle.这部分很简单.具体来说,假设我有一个类"A",它具有对文件进行操作的方法.如果它不包含文件句柄,我可以pickle这个对象.我希望能够创建文件句柄以访问"A"描述的资源.如果我在类"A"中有一个"open()"方法打开并存储文件句柄供以后使用,那么"A"不再是pickleable.(我在这里添加打开文件包括一些不能缓存的非平凡索引 - 第三方代码 - 因此在需要时关闭和重新打开并非没有费用).我可以将类"A"编码为可以生成所描述文件的文件句柄的工厂,但这可能导致多个文件句柄同时访问文件内容.我可以使用另一个类"B"来处理类"A"中文件的打开,包括锁定等.我可能会过度思考这个,但任何提示都会受到赞赏.
我经常远程运行R,并且在RStudio服务器上取得了巨大的成功.但是,Emacs/ESS在许多情况下仍然是可取的,特别是因为我经常同时处理多个项目.当预期连接将被破坏时,在emacs中运行ESS/R时,最先进的是什么？更具体一点,我喜欢在Emacs中运行tmux会话,这样我就可以连接到在tmux(或屏幕)中运行的长时间运行的R会话.ESS/Emacs支持这种情况的状态是什么？这似乎随着时间的推移而发生变化,我还没有找到"明确的"方法(也许没有一种方法).
我正在按照说明使用初始化脚本启动Jupyter Notebook来启动Google DataProc集群。
如何在Jupyter笔记本（尤其是pyspark）的结果SparkContext中包含额外的JAR文件（例如，spark-xml）？
我有一些将页面加载到 iframe 的 html。这适用于此页面，例如：
但是，像这样的页面：
https://twitter.com/seandavis12/
结果是一个空的 iframe。我怀疑这与使用 javascript 部分呈现来自 twitter 的页面有关，但我不确定如何强制页面显示在 iframe 中。有什么建议？
我测试过的环境：Mac OS 上的 chrome 和 safari
最小的例子：
<html>
<body>
<iframe src="https://seandavi.github.io"></iframe>
<iframe src="https://twitter.com/seandavis12/"></iframe>
</body>
</html>我在 AWS EKS 上运行了一个简单的单 pod postgresql 部署（代码在这里）。我已经使用负载平衡器公开了 pod。
kubectl get services/postgres-lb -o yaml
这产生以下结果：
apiVersion: v1
kind: Service
metadata:
annotations:
service.beta.kubernetes.io/aws-load-balancer-connection-draining-enabled: "false"
service.beta.kubernetes.io/aws-load-balancer-type: nlb
creationTimestamp: 2019-04-23T02:36:54Z
labels:
app: postgres
name: postgres-lb
namespace: default
resourceVersion: "1522157"
selfLink: /api/v1/namespaces/default/services/postgres-lb
uid: <HASHREMOVED?
spec:
clusterIP: 10.100.94.170
externalTrafficPolicy: Cluster
ports:
- nodePort: 32331
port: 5434
protocol: TCP
targetPort: 5432
selector:
app: postgres
sessionAffinity: None
type: LoadBalancer
status:
loadBalancer:
ingress:
- hostname: ...aaadz-example.elb.us-east-1.amazonaws.com
这有效，我可以按预期访问 pod。但是，如果不活动，与 postgresql 的连接似乎每分钟左右就会下降。我很确定至少有一些 AWS 负载均衡器会以这种方式“耗尽连接”；因此上面的注释不排除连接。但是，我仍然看到在空闲时断开连接的相同行为。
例如，AWS EKS 上托管数据库然后将其单个端口暴露给 Internet 的最佳实践是什么？网络搜索出现了许多变体，但所有变体要么过于复杂，要么不直接适用。我使用过 …
我有一组文件名,如:
PATJVI_RNA_Tumor_8_3_63BJTAAXX.310_BUSTARD-2012-02-19.fq.gz
PATMIF_RNA_Tumor_CGTGAT_2_1_BC0NKBACXX.334_BUSTARD-2012-05-07.fq.gz
我想有一个正则表达式(在python中,fyi)可以捕获"_"字符之间的每个组.但请注意,在第二个文件名中,存在一个不存在于第一个文件名中的组.当然,可以使用字符串拆分等,但我想用一个正则表达式来做这个.第一个文件名的正则表达式如下:
(\w+)_(\w+)_(\w+)_(\d)_(\d)_(\w+)\.(\d+)_(\S+)\.fq\.gz
第二个是:
(\w+)_(\w+)_(\w+)_(\w+)_(\d)_(\d)_(\w+)\.(\d+)_(\S+)\.fq\.gz
当可选组存在时,我希望正则表达式组为空,并且当它存在时包含可选组(这样我以后可以使用它来构造带有\ 4的新文件名).
我正在使用基于PBS的集群,并在一组节点上运行IPython并行,每个节点有24或32个内核,内存范围从24G到72G; 这种异质性是由于我们的集群有历史.另外,我发送给IPython集群的作业有不同的资源要求(核心和内存).我正在寻找一种方法来向ipython集群提交工作,这些工作了解他们的资源需求以及可用引擎的资源需求.我想有一种方法可以使用IPython功能优雅地处理这种情况,但我还没有找到它.有关如何进行的任何建议？
我想将 R 表达式解析为列表，并在最终将其转换为 json 对象之前选择性地修改它的各个方面。举个例子，我正在尝试实现以下目标：
{"op": "=",
"content": {
"lhs": "gender",
"rhs": ["male"]
}
}
我将从 R 表达式开始，例如：
gender == "male"
我可以用来pryr::ast获取树的文本版本，但我想将其作为列表获取，例如：
op: "=="
[[1]]: "gender"
[[2]]: "male"
列表的“格式”细节并不那么重要，只要清楚即可。我的目标只是获得一个可计算且可修改的 R 表达式解析树。
我想在两个Spark DataFrames（Scala）上执行“联接”，但是我想将第二个DataFrame的“ joined”行作为单个嵌套列插入第一个，而不是类似SQL的联接。这样做的原因最终是使用嵌套结构写回JSON。我知道答案可能已经在Stackoverflow上了，但是一些搜索并没有找到我的答案。
表格1
root
|-- Insdc: string (nullable = true)
|-- LastMetaUpdate: string (nullable = true)
|-- LastUpdate: string (nullable = true)
|-- Published: string (nullable = true)
|-- Received: string (nullable = true)
|-- ReplacedBy: string (nullable = true)
|-- Status: string (nullable = true)
|-- Type: string (nullable = true)
|-- accession: string (nullable = true)
|-- alias: string (nullable = true)
|-- attributes: array (nullable = true)
| |-- element: struct (containsNull = true)
| | …python ×3
apache-spark ×2
r ×2
emacs ×1
ess ×1
grouping ×1
html ×1
iframe ×1
ipython ×1
javascript ×1
kubernetes ×1
pickle ×1
postgresql ×1
pryr ×1
regex ×1
scala ×1
session ×1
tmux ×1