上周我决定尝试Perl6并开始重新实现我的一个程序.我不得不说,Perl6对于对象编程来说非常简单,这在Perl5中对我来说非常痛苦.
我的程序必须读取和存储大文件,例如全基因组(高达3 Gb或更高,参见下面的示例1)或制表数据.
代码的第一个版本是通过逐行迭代("genome.fa".IO.lines)以Perl5方式制作的.对于正确的执行时间来说,它非常缓慢且无法确定.
my class fasta {
has Str $.file is required;
has %!seq;
submethod TWEAK() {
my $id;
my $s;
for $!file.IO.lines -> $line {
if $line ~~ /^\>/ {
say $id;
if $id.defined {
%!seq{$id} = sequence.new(id => $id, seq => $s);
}
my $l = $line;
$l ~~ s:g/^\>//;
$id = $l;
$s = "";
}
else {
$s ~= $line;
}
}
%!seq{$id} = sequence.new(id => $id, seq => $s);
}
}
sub MAIN()
{ …
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