小编use*_*635的帖子

我正在尝试运行mbin进行甲基化分析。但是得到错误消息：h5py.h5py_warnings.H5pyDeprecationWarning: dataset.value has been deprecated. Use dataset[()] instead. 多次尝试，同时尝试使用 buildcontrols 提取控制 IPD。
环境：

• mbin 版本：1.1.1
• Python版本：2.7.12
• 操作系统：centOS
• 在 virtualenv 下运行

我还以为是版本问题。我尝试过的：我在同时使用 python 3 和 2 的服务器上尝试过。并指定 virtualenv 使用 python 2 作为解释器。mbin 已成功安装，但 buidlcontrols 没有。

(virtualenv_for_mbin) [yx@localhost virtualenv_for_mbin]$ buildcontrols -i --procs=4 --control_pkl_name=control_means_190201.pkl /data1/yuxiao/userdata1/jobs/016/016504/data/aligned_reads.cmp.h5
2019-02-01 23:36:31 [INFO] Initiating dictionary of all possible motifs...
2019-02-01 23:36:31 [INFO]   - Adding 256 4-mer motifs...
2019-02-01 23:36:31 [INFO] Done: 256 possible contiguous motifs

2019-02-01 23:36:31 [INFO]   - Adding 1024 5-mer motifs...
2019-02-01 23:36:31 …