您好我已经开始使用matplotlib并一直在尝试调整网站上的示例代码以满足我的需求.我有下面的代码,我想要的除了每组中的第3个栏与第一组下一个栏重叠.互联网不足以添加图片,但任何帮助都会很棒,如果你能解释我的错误是什么,将不胜感激.
谢谢,汤姆
"""
Bar chart demo with pairs of bars grouped for easy comparison.
"""
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
n_groups = 3
means_e1 = (20, 35, 30)
std_e1 = (2, 3, 4)
means_e2 = (25, 32, 34)
std_e2 = (3, 5, 2)
means_e3 = (5, 2, 4)
std_e3 = (0.3, 0.5, 0.2)
fig, ax = plt.subplots()
index = np.arange(n_groups)
bar_width = 0.35
opacity = 0.4
error_config = {'ecolor': '0.3'}
rects1 = plt.bar(index , means_e1, bar_width,
alpha=opacity, …S0 我试图运行的命令是；
java -jar -Xmx290G /ibers/ernie/home/thh32/rumenISPG/GenomeAnalysisTK.jar -T VariantFiltration -R Contigs_1.fa -V Rank10_clean.fasta.gz.Contig_1-sort.bam.vcf1.vcf --filterExpression "QD < 2.0 || FS > 60.0 || MQ < 40.0 || HaplotypeScore > 13.0 || MappingQuality RankSum < -12.5 " --filterName "testing_filter" -o filtered_snps.vcf
我正在运行它的机器可以访问 500G RAM，所以应该不是问题，但是我不断收到此错误消息；
Error occurred during initialization of VM
Unable to allocate 9502720KB bitmaps for parallel garbage collection for the requested 304087040KB heap.
Error: Could not create the Java Virtual Machine.
Error: A fatal exception has occurred. Program will exit.
有没有其他人遇到过这个问题，如果有，你解决了吗？
哦，也只是为了防止人们想知道为什么我给这个程序这么多内存，当我没有收到这条消息时，表明它需要更多的内存。这是 …
我一直在我正在编写的程序中使用 argparse，但它似乎没有创建指定的输出文件。
我的代码是：
parser.add_argument("-o", "--output", action='store', dest='output', help="Directs the output to a name of your choice")
with open(output, 'w') as output_file:
output_file.write("%s\n" % item)
我也试过：
parser.add_argument("-o", "--output", action='store', type=argparse.FileType('w'), dest='output', help="Directs the output to a name of your choice")
output_file.write("%s\n" % item)
发生的错误是：
output_file.write("%s\n" % item)
NameError: name 'output_file' is not defined
有人可以解释为什么我会发生这个错误以及我如何解决它？
我所有的代码：
from __future__ import print_function
from collections import defaultdict
from itertools import groupby
import argparse #imports the argparse module so it can be used
from itertools import …我有一个制表符分隔表,我想要打印列'x'大于'Y'的所有行.我尝试使用下面的代码,但我是使用awk的新手,所以我不确定如何根据列使用它.
awk '$X >= Y {print} ' Table.txt | cat > Wanted_lines
Y是1到100之间的值.
如果输入如下,列X是第二列.
1 30
2 50
3 100
4 100
5 80
6 79
7 90
想要的输出是:
3 100
4 100
5 80
7 90
该文件的前两行是:
1 OTU1 243622 208679 121420 265864 0 0 2 0 0 11 1 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 839604 OTU1 - Archaea 100% Euryarchaeota 100% Methanobacteria 100% Methanobacteriales 100% Methanobacteriaceae …