我想完成这样的工作,但遇到了困难:
我有一大堆文本.每一行的格式"AGTCCCGGAT filename"都是第一部分是DNA的东西.
教授建议我们将这个巨大的文件分成许多临时文件并用heapq.merge()它们进行排序.目标是在末尾有一个文件,其中包含原始文件的每一行并进行排序.
我的第一次尝试是将每一行分成一个单独的临时文件.问题是heapq.merge()报告有太多文件要排序.
我的第二次尝试是将它分成50000行的临时文件.问题是它似乎不是按行排序,而是按文件排序.例如,我们有类似的东西:
ACGTACGT filename
CGTACGTA filename
ACGTCCGT filename
CGTAAAAA filename
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
前两行来自一个临时文件,后两行来自第二个文件.
我对它们进行排序的代码如下:
for line in heapq.merge(*[open('/var/tmp/L._Ipsum-strain01.fa_dir/'+str(f),'r') for f in os.listdir('/var/tmp/L._Ipsum-strain01.fa_dir')]):
result.write(line)
result.close()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 我正在尝试使用 Python 删除临时文件。我的操作系统是 Windows。
现在,我注意到使用os.system("del xxx")删除该文件对我来说是有意义的,但是有没有办法使它通用?例如,让它也能在 Mac 或 Linux 上运行?我知道这些系统使用“rm”而不是“del”。
谢谢!