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SGE 数组作业和 R

我目前编写了一个 R 脚本来执行群体遗传模拟,然后将包含结果的表格写入文本文件。我想使用数组作业(我大学的集群使用 SGE)以某种方式并行运行此脚本的多个实例,当全部完成后,我将生成与每个作业相对应的结果文件(Results_1.txt、Results_2.txt 等) .)。

花了下午的大部分时间阅读并试图找出如何做到这一点,但还没有真正找到任何符合我想做的事情。我想知道是否有人可以提供示例,或者为我指明一些我可以阅读的内容以帮助解决此问题。

arrays r bioinformatics sungridengine

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如何随机化列顺序的子集

我有一个数据框,我想随机改组某些列的顺序.例如,这是一个代表我所拥有的例子:

V1  V2  V3  V4  V5  V6  V7  V8  V9  V10 V11 V12 V13 V14
ch1 12  A   9   10  6   5   6   3   4   6   5   7   5
ch2 13  T   7   10  1   7   3   3   3   1   7   8   6
ch3 14  T   5   7   7   2   6   8   1   1   8   1   5
ch4 15  G   8   9   2   7   9   7   7   3   10  10  4
ch5 16  T   8   2   8   2   4   7 …
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r shuffle permutation

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