小编Ron*_*uza的帖子

像 Gephi Force Atlas 2 一样绘制 igraph 网络

我有一个具有以下特征的网络(igraph):

>g
IGRAPH DN-- 3370 16699 --
+ attr: name (v/c), grupo (v/n), year (v/n), grupo.freq (v/n),
  grupo.perc (v/n), vertex.frame.size (v/n), color (v/c),
  vertex.frame.color (v/c), grupo (e/n), year (e/n), color (e/c)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

make clustering 后有以下组:

>table(V(g)$grupo)
   1    2    8
1516 1367  487
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我对能够突出群体之间关系的观点感兴趣(V(g)$grupo)。我使用该软件Gephi来布局Force Atlas 2下一张图片: https://i.stack.imgur.com/GQxyT.png

我的问题是,如何在 R 中得到类似的结果?

我正在使用以下代码:

colbar <- rainbow(length(table(V(g)$grupo)))
V(g)$color <- colbar
E(g)$color <- colbar
V(g)$vertex.frame.color <- colbar
V(g)$vertex.frame.size <- 0.1

plot.igraph(
            g,
            layout=layout.fruchterman.reingold.grid,
            vertex.label=NA,
            vertex.size=1,
            edge.lty=1,
            edge.arrow.size=0.0000001
            )
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

点击链接下载我在csv …

plot r igraph gephi

4
推荐指数
1
解决办法
4140
查看次数

标签 统计

gephi ×1

igraph ×1

plot ×1

r ×1