小编mma*_*rks的帖子

Mac 上 Finder 中的 Rproj 文件中的 Rproj 图标现在缺失或为空白

不知道为什么,但突然我的 .Rproj 文件没有图标。请参阅示例屏幕截图。运行最新的 R Studio,尝试删除 R studio 并重新安装。尝试将文件切换为不同的默认程序,然后切换回来...... 在此输入图像描述

有人知道如何恢复此文件类型的默认图标吗?

rstudio

7
推荐指数
1
解决办法
493
查看次数

在 Rmarkdown 文档的 YAML-Header 部分包含额外的文本/超链接部分

我正在用 RMarkdown 编写一个文档,希望有一个关于在标题部分包含额外信息的相当简单的查询。

我的 rmd 的标题部分如下所示:

---
title: "My R-Markdown Document"

author: "[My name here](a hyperlink to my institutional page)"

output: html_document
---
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我正在尝试在我的名字后添加一个简单的额外行,其中包括我的 Twitter 句柄

我尝试通过将其添加为摘要来作弊....:

---
    title: "My R-Markdown Document"

    author: "[My name here](a hyperlink to my institutional page)"

    abstract: "[I'm on Twitter](hyperlink)"

    output: html_document
    ---
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

但是在额外信息之前显示标题摘要,即我得到

“摘要:我在推特上”

而所需的输出是

标题文字

名称(超链接)

我在推特上(超链接)

有谁知道如何让这个工作?我查看了PANDOC 指南和其他示例,并尝试了各种将其称为描述、研究所的东西,但除了上面突出显示的问题的摘要之外,这些似乎都没有呈现。

注意:修改的额外查询这适用于 HTML 输出,但如果 output == PDF 似乎不适用于该领域的任何建议也欢迎!

yaml r r-markdown

5
推荐指数
1
解决办法
2138
查看次数

GLM 模型在交互式代码中运行,但在我使用 knitr 时不运行

我有问题knitr。具体来说,我有一个模型在控制台中运行得非常好,但是当我尝试编织文档时,R 会引发错误。

加载数据集(此处可用以方便复制

scabies <- read.csv(file = "S1-Dataset_CSV.csv", header = TRUE, sep = ",")
scabies$agegroups <- as.factor(cut(scabies$age, c(0,10,20,Inf), labels = c("0-10","11-20","21+"), include.lowest = TRUE)) 
scabies$agegroups <-relevel(scabies$agegroups, ref = "21+")
scabies$house_cat <- as.factor(cut(scabies$house_inhabitants, c(0,5,10,Inf), labels = c("0-5","6-10","10+"), include.lowest = TRUE))
scabies$house_cat <- relevel(scabies$house_cat, ref = "0-5")
scabies <- scabies %>% mutate(scabies = case_when(scabies_infestation=="yes"~1,
                                                  scabies_infestation=="no"~0)) %>%
                      mutate(impetigo = case_when(impetigo_active=="yes" ~1,
                                                  impetigo_active=="no" ~0))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

拟合模型

scabiesrisk <- glm(scabies~agegroups+gender+house_cat,data=scabies,family=binomial())
scabiesrisk_OR <- exp(cbind(OR= coef(scabiesrisk), confint(scabiesrisk)))
scabiesrisk_summary <- summary(scabiesrisk)
scabiesrisk_summary <- cbind(scabiesrisk_OR, scabiesrisk_summary$coefficients) …
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

r glm knitr

3
推荐指数
1
解决办法
232
查看次数

翻转表中的列/行

我正在使用epiR软件包,因为它具有优秀的2比2列联表,比值比和人口归因分数.

通常我的数据被编码为0 =否1 =是

所以,当我这样做

tabele(var_1,var_2)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

输出以对齐的表格形式出现

在此输入图像描述

对于它的输入虽然epiR希望左上方为Exposed + VE Outcome + VE - 即左上方应为Var 1 == 1且Var 2 == 1

目前我通过将零重新编码为2或者通过设置为因子并使用重新级别来执行此操作.这些都对其他分析有点烦人,因为一般来说我希望Outcome + VE来自Outcome-VE

所以我想知道是否有一种简单的方法(在表内?)来翻转表的方向,以便它基本上反转行/列的顺序?

希望以上是有道理的 - 如果没有,我很乐意提供澄清.


编辑:感谢以下建议; 只是为了澄清我希望能够在从现有数据帧变量调用表时执行此操作 - 即我正在做的是表(数据$ var_1,数据$ var_2) - 理想情况下无需创建一个全新的对象

r contingency

1
推荐指数
1
解决办法
103
查看次数

标签 统计

r ×3

contingency ×1

glm ×1

knitr ×1

r-markdown ×1

rstudio ×1

yaml ×1