我希望能够将R中创建的矩阵存储在内存中并返回指针.然后使用指针从内存中取回矩阵.我正在运行R版本3.0.1(2013-05-16) - Ubuntu 13.01上的"Good Sport"和Rcpp版本"0.10.6".我试过了 ...
// [[Rcpp::export]]
SEXP writeMemObject(NumericMatrix mat)
{
XPtr<NumericMatrix> ptr(&mat, true);
return ptr;
}
// [[Rcpp::export]]
NumericMatrix getMemObject(SEXP ptr)
{
XPtr<NumericMatrix> out(ptr);
return wrap(out);
}
# This returns a pointer
x <- writeMemObject(matrix(1.0))
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但是当我再次尝试时,这会失败并且崩溃R.
getMemObject(x)
Error: not compatible with REALSXP
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 这是一个跟进到先前的问题在这里存储和使用XPTR在内存中检索矩阵-这是飞驰的回答-非常感谢你.现在我可以使用xptr在内存中创建和检索矩阵如何正确地完成/销毁对象.Rcpp对象应该在删除时自动进行垃圾收集,但是当我创建指针时,如果我在RI中删除它必须运行gc()两次以恢复内存,例如
// This function wraps the matrix an returns a pointer
// [[Rcpp::export]]
SEXP writeMemObject(NumericMatrix mat)
{
XPtr<NumericMatrix> ptr(new NumericMatrix(mat), true);
return ptr;
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
检索矩阵的函数(从上一个答案)
// [[Rcpp::export]]
NumericMatrix getMemObject(SEXP ptr)
{
XPtr<NumericMatrix> out(ptr);
return *out;
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
然后在R
createMemMatrix <- function(dims){
ptr <- writeMemObject(matrix(runif(prod(dims)), nc = dims[2]))
return(ptr)
}
ptr <- createMemMatrix(c(1e4, 1e4))
#mat <- getMemObject(ptr) # this works but not run here
rm(ptr);
gc(); # nothing seems to happen in memory
gc(); # memory is freed (visible in …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)