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igraph (R) 如何创建只有强 r 值的相关网络

我试图弄清楚如何使用 graph.adjacency 使用相关矩阵(值 -1 到 1)创建图形,但只包含图形文件中包含的最强烈相关的边,即 <-.8 或 >。 8

这是成功为我提供具有完整数据集的网络的代码:

corrdata<-read.csv("spearmancorr.csv",header=FALSE)
cor_mat<-as.matrix(corrdata)
diag(cor_mat)<-0
graph<-graph.adjacency(cor_mat,weighted=TRUE,mode="lower")
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我尝试使用 delete.edges 将网络减少到至少 >.8 以进行测试,但生成的文件仍然显示边缘权重低于 0.8

graph.copy <- delete.edges(graph, which(E(graph)$weight !<0.8)-1)
write.graph(graph.copy, file="gsig80.graphml", format="graphml")
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关于如何获取我想要的图形文件的任何建议?

r igraph correlation

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