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如何在 nextflow 中执行 try catch？

我目前正在编写一个管道，其中我正在执行的 bash 命令可能在某些条件下以退出代码 1 退出。这使我的管道陷入停滞。我现在想使用 try catch 子句来定义一些替代行为，以防发生这种情况。

我尝试过以常规方式执行此操作，但似乎不起作用：

process align_kallisto {

    publishDir "${params.outdir}/kallisto", mode: 'copy', saveAs:{ filename -> "${name}_abundance.tsv" }   

    input:
    tuple val(name), file(fastq) from fq_kallisto.dump(tag: 'kallisto fq')
    file(index) from kallisto_index.collect().dump(tag: 'kallisto index')

    output:
    file("output/abundance.tsv") into kallisto_quant

    // this can throw an exit 1 status
    try {
        """
        kallisto quant -i ${index} --bias --single --fr-stranded -o output --plaintext \
          --fragment-length ${params.frag_length} --sd ${params.frag_deviation} ${fastq}
        """
    } 
    // if this happens catch and do something …