我有一个来自 R 的文件。它基本上是write.table使用 as delimiter 命令的输出" "。该文件的示例如下所示：
file1.txt
5285 II-3 II-2 2 NA NA NA NA 40 NA NA c.211A>G
8988 III-3 III-4 1 NA NA NA NA NA NA NA c.211A>G
8F412 III-3 III-4 2 NA NA 28 NA NA NA NA c.211A>G
4H644 III-3 III-4 2 NA NA NA NA NA NA NA NA
我需要得到的是一个非常特定格式的新文件，基本上我需要使用空格对齐所有列，我不能使用制表符。
所需的输出将是
5285 II-3 II-2 2 NA NA NA NA 40 NA NA c.211A>G
8988 III-3 III-4 1 NA NA …我有一个data.frame,其中2列代表2个基因之间的相互作用.如何查看data.frame的示例:
head(df)
V1 V2
A1BG A1BG
A1BG CRISP3
A1CF A1CF
A1CF APOBEC1
A1CF CUGBP2
A1CF KHSRP
我想根据第一列的值拆分data.frame,我使用了以下命令:
out <- split(df, df$V1)
期望的输出应该是:
out
$A1BG
[1] A1BG CRISP3
$A1CF
[2] A1CF APOBEC1 CUGBP2 KHSRP
但是,使用split的过程需要很长时间,因为我的文件太大(大约200,000行)
非常感谢
这是一个简单的问题，我如何知道数字列表中的哪个元素小于n数字，例如在这个虚拟示例中，如何获取少于 5 个元素的元素？
list <- list(A=1:5, B=1, C=1:2, D=1, e=5:10)
所需的输出将是元素的名称（B、C 和 D）
谢谢
我有一个看起来像这样的data.frame:
df <- data.frame(names=c("A", "B", "C", "D", "E", "F", "G", "H", "I", "J", "K"),
values=c(1,1,4,6,7,7,7,9,9,14,15))
我想要类似的东西:
df <- data.frame(names=c("A", "B", "C", "D", "E", "F", "G", "H", "I", "J", "K"),
values=c(1,1,2,3,4,4,4,5,5,6,7))
我知道这是一个愚蠢的问题,但我不知道该怎么做.谢谢
注意:第二个data.frame中的值应该是从1到n的顺序
我需要根据一些列拆分大约500万行的文件,即我需要在不同的块上保留一些列.我知道用于逐行拆分的split命令,但是不知道是否有任何类似的功能可以按照我想要的方式逐列拆分.我的文件有196 ANN列
SNPID CHR POS Z F N LNBF ANN1 ANN2 ANN3
rs367896724 1 10177 0 0 0 -3.36827717630604 0 0 0
rs555500075 1 10352 0 0 0 -2.30999509213213 0 1 0
rs575272151 1 11008 0 0 0 -1.14611711529388 0 0 1
rs544419019 1 11012 0 0 0 -1.14611711529388 1 1 1
期望的输出将是
#chunk1
SNPID CHR POS Z F N LNBF ANN1
rs367896724 1 10177 0 0 0 -3.36827717630604 0
rs555500075 1 10352 0 0 0 -2.30999509213213 0
rs575272151 …我有两个不同尺寸的数据帧,
df1 <- data.frame(names= sample(LETTERS[1:10]), duration=sample(0:100, 10))
>df1
names duration
1 J 97
2 G 57
3 H 53
4 A 23
5 E 100
6 D 90
7 C 73
8 F 60
9 B 37
10 I 67
df2 <- data.frame(names= LETTERS[1:5], names_new=letters[1:5])
> df2
names names_new
1 A a
2 B b
3 C c
4 D d
5 E e
我想在更换df1相匹配的价值df1$names和df2$names但使用df2$names_new.我想要的输出是:
> df1
names duration
1 J 97 …