小编Ale*_*dOn的帖子

我正在使用用于分子机械力场的amber12软件来模拟生物分子,我按照下一个链接中描述的安装说明在Mac OS X中使用琥珀色IUTElation程序实际工作但是在尝试执行程序部分软件时停下来说

Fortran运行时错误:文件结束

1.这就是我的工作,首先访问包含文件的文件夹

N-terminal-2:~ javieralejandrorendoncarrillo$ cd Desktop/amber/Complex1

2.然后设置路径

N-terminal-2:Complex1 javieralejandrorendoncarrillo$ export AMBERHOME=/Users/javieralejandrorendoncarrillo/amber/amber12

3.最后在下一个命令行执行程序:

N-terminal-2:Complex1 javieralejandrorendoncarrillo$ $AMBERHOME/bin/sander.MPI -O -i min.in -o min_complex.out -p complex.prmtop -c complex.inpcrd -r complex_min.crd &
[2] 13377
N-terminal-2:Complex1 javieralejandrorendoncarrillo$ At line 524 of file mdread.F90 (unit = 5, file = 'min.in')
Fortran runtime error: End of file

[2]-  Exit 2                  $AMBERHOME/bin/sander.MPI -O -i min.in -o min_complex.out -p complex.prmtop -c complex.inpcrd -r complex_min.crd
N-terminal-2:Complex1 javieralejandrorendoncarrillo$ 

该文件min.in保存在文件夹中Complex 1,我正在运行模拟这是脚本min.in

Initial minimisation …