我正在尝试使用OpenMP在以下函数中并行化循环
void CEnergymulti::forcetwobody(vector<CMolecule*> m_mols,CPnt force0,CPnt torque0)
{
const int nmol=m_mols.size();
vector<CMolecule*> twomols(2);
CPnt forcetemp,torquetemp;
twomols.clear();
force0.zero();
torque0.zero();
forcetemp.zero();
torquetemp.zero();
#pragma omp parallel for reduction(+:force0,torque0) private(twomols)
for(int j=1;j<nmol;j++)
{ twomols.push_back(m_mols[0]);
twomols.push_back(m_mols[j]);
CMolecule::polarize_mutual(twomols,false, 1000);
twomols[0]->computeMol_Force_and_Torque(forcetemp,torquetemp);
force0+=forcetemp;
torque0+=torquetemp;
forcetemp.zero();
torquetemp.zero();
twomols.clear();
}
REAL converter=COUL_K*IKbT;
force0*=converter;
torque0*=converter;
return;
}
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当我编译代码时,它给出以下消息:
EnergyD_multi.cpp: In static member function ‘static void
CEnergymulti::forcetwobody(std::vector<CMolecule*,
std::allocator<CMolecule*> >, CPnt, CPnt)’: EnergyD_multi.cpp:226:
error: ‘torque0’ has invalid type for ‘reduction’
EnergyD_multi.cpp:226: error: ‘force0’ has invalid type for
‘reduction’
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我知道变量'force0'和'torque0'既不是双重或整数类型的数据,而是类型'CPnt',这是一个定义为表示空间中三维向量的类.对于类'CPnt',运算符'+'和' - '已经由运算符重载定义.所以我的问题是:OpenMP的减少是否真的无法处理这样的重载运算符?有没有其他方法可以将此循环与OpenMP并行化而不减少'force0'和'torque0'的每个组件?
非常感谢.
我有多个文件,我想同时读取它们,从每行中提取一个数字并进行平均值.对于少量文件,我在itertools模块中使用izip执行此操作.这是我的代码.
from itertools import izip
import math
g=open("MSDpara_ave_nvt.dat",'w')
with open("sample1/err_msdCECfortran_nvt.dat",'r') as f1, \
open("sample2/err_msdCECfortran_nvt.dat",'r') as f2, \
open("sample3/err_msdCECfortran_nvt.dat",'r') as f3, \
open("err_msdCECfortran_nvt.dat",'r') as f4:
for x,y,z,bg in izip(f1,f2,f3,f4):
args1=x.split()
i1 = float(args1[0])
msd1 = float(args1[1])
args2=y.split()
i2 = float(args2[0])
msd2 = float(args2[1])
args3=z.split()
i3 = float(args3[0])
msd3 = float(args3[1])
args4=bg.split()
i4 = float(args4[0])
msd4 = float(args4[1])
msdave = (msd1 + msd2 + msd3 + msd4)/4.0
print>>g, "%e %e" %(i1, msdave)
f1.close()
f2.close()
f3.close()
f4.close()
g.close()
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这段代码工作正常.但是,如果我想同时处理100个文件,如果我这样做,代码会变得非常冗长.还有其他更简单的方法吗?似乎fileinput模块也可以处理多个文件,但我不知道它是否可以同时执行.
谢谢.