小编use*_*262的帖子

计算原子坐标之间的距离

我有一个文本文件,如下所示

ATOM    920  CA  GLN A 203      39.292 -13.354  17.416  1.00 55.76           C 
ATOM    929  CA  HIS A 204      38.546 -15.963  14.792  1.00 29.53           C
ATOM    939  CA  ASN A 205      39.443 -17.018  11.206  1.00 54.49           C  
ATOM    947  CA  GLU A 206      41.454 -13.901  10.155  1.00 26.32           C
ATOM    956  CA  VAL A 207      43.664 -14.041  13.279  1.00 40.65           C 
.
.
.

ATOM    963  CA  GLU A 208      45.403 -17.443  13.188  1.00 40.25           C  
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我想计算两个α碳原子之间的距离,即计算第一和第二原子之间的距离,然后计算第二和第三原子之间的距离等等......两个原子之间的距离可以表示为:distance = sqrt((x1-x2)^2+(y1-y2)^2+(z1-z2)^2) …

python perl biopython bioperl

3
推荐指数
2
解决办法
5324
查看次数

标签 统计

bioperl ×1

biopython ×1

perl ×1

python ×1