小编nov*_*eek的帖子

我在一个文件夹中有一组文件,所有文件都以类似的名字开头,除了一个.这是一个例子:

Coordinate.txt
Spectrum_1.txt
Spectrum_2.txt
Spectrum_3.txt
.
.
.
Spectrum_11235

我能够列出指定文件夹中的所有文件,但列表不是频谱号的升序.示例:执行程序时,我得到以下结果:

Spectrum_999.txt
Spectrum_9990.txt
Spectrum_9991.txt
Spectrum_9992.txt
Spectrum_9993.txt
Spectrum_9994.txt
Spectrum_9995.txt
Spectrum_9996.txt
Spectrum_9997.txt
Spectrum_9998.txt
Spectrum_9999.txt

但这个顺序不正确.Spectrum_999.txt之后应该有Spectrum_1000.txt文件.有人可以帮忙吗？这是代码:

import java.io.*;
import java.util.Arrays;
import java.util.Comparator;
import java.util.Scanner;

    public class FileInput {

        public void userInput()
        {
            Scanner scanner = new Scanner( System.in );
            System.out.println("Enter the file path: ");
            String dirPath = scanner.nextLine(); // Takes the directory path as the user input

            File folder = new File(dirPath);
            if(folder.isDirectory())
            {
                File[] fileList = folder.listFiles();

                Arrays.sort(fileList);

                System.out.println("\nTotal number of items present …

我在R中有一个24行和10,000列的数字矩阵.该矩阵的行名基本上是文件名,我从中读取了对应于24行中每一行的数据.除此之外,我有一个单独的因子列表,包含24个entires,指定24个文件所属的组.有3组 - 醇类,碳氢化合物和酯类.它们所属的名称和相应组如下所示:

> MS.mz
[1] "int-354.19" "int-361.35" "int-368.35" "int-396.38" "int-408.41" "int-410.43" "int-422.43"
[8] "int-424.42" "int-436.44" "int-438.46" "int-452.00" "int-480.48" "int-648.64" "int-312.14"
[15] "int-676.68" "int-690.62" "int-704.75" "int-312.29" "int-326.09" "int-326.18" "int-326.31"
[22] "int-340.21" "int-340.32" "int-352.35"

> MS.groups
[1] Alcohol     Alcohol     Alcohol     Alcohol     Hydrocarbon Alcohol     Hydrocarbon Alcohol    
[9] Hydrocarbon Alcohol     Alcohol     Alcohol     Ester       Alcohol     Ester       Ester      
[17] Ester       Alcohol     Alcohol     Alcohol     Alcohol     Alcohol     Alcohol     Hydrocarbon
Levels: Alcohol Ester Hydrocarbon

我想生成一个树形图来查看矩阵中的数据是如何聚类的.所以,我使用了以下命令:

require(vegan)
dist.mat<-vegdist(MS.data.scaled.transposed,method="euclidean")
clust.res<-hclust(dist.mat)
plot(clust.res)

我得到了一个树状图.现在我想根据它们所属的组(即酒精,碳氢化合物或酯类)为树形图中的文件名着色.我查看了论坛上发布的不同例子

r中的标签和颜色叶树形图

使用猿包的R中的标签和颜色叶树形图

使用自举进行群集

,但无法为我的数据实现它.我不确定如何将row.names与MS.groups相关联以获得树形图中的彩色名称.

在使用dendextend生成树时(如https://nycdatascience.com/wp-content/uploads/2013/09/dendextend-tutorial.pdf中所述),我得到以下树

以下是用于生成它的代码: …

我正在研究R中的图像处理.目前我正在使用默认的配色方案(topo,terrain,rainbow,heat,cm).但是,我想使用Matlab提供的配色方案(特别是黑色到黄色配色方案 - 热)和R.有没有办法在R中使用这些配色方案？我使用了OOMPA软件包,其中包括用于生物图像的其他颜色方案(http://bioinformatics.mdanderson.org/Software/OOMPA/ClassDiscovery/html/colorSchemes.html),但这并没有解决目的.

Matlab配色方案http://www.mathworks.de/help/matlab/ref/colormap-dropdown.gif

我正在使用SwingWorker类使进程在另一个线程中运行。我想要的是，一旦这个线程完成处理，它应该返回 aString并且它应该启用 a JMenuItem。我正在使用类中的done()方法SwingWorker来启用，JMenuItem但我收到一个NullPinterException. 该doInBackground()方法返回一个我想在主 GUI 类中访问的字符串 - GUIMain.java，存在于同一个包中。我该怎么做？我看到了很多实现done()或onPostExecute()方法的例子，但我认为我在某个地方出错了。这是我实现的代码：

 public class GUIMain extends JFrame implements ActionListener, FocusListener, ItemListener, MouseListener, MouseMotionListener {

        private JMenuBar menuBar;    // Defined a menuBar item
        private JMenu recalibrationMenu;  // Define the recalibration menu item
        private JMenuItem CGMenuItem;
        private JMenuItem TGMenuItem;
        private JMenu viewResultsMenu;  // Define the View Results menu item
        public JMenuItem cgResults;
        public JMenuItem tgResults; …