小编Ken*_*ams的帖子

测试/和inst/tests/R包之间的区别

我正在开发一个新的包,我有一些单元测试要写.tests/和之间有什么区别inst/tests/?每种东西应该包含哪些东西?

特别是,我在http://journal.r-project.org/archive/2011-1/RJournal_2011-1_Wickham.pdf中看到Hadley建议使用inst/tests/"因此用户也可以访问它们",然后将引用放入tests/运行中商场.但为什么不把它们全部放入tests/

testing packages r

9
推荐指数
2
解决办法
540
查看次数

readRDS()加载额外的包

在什么情况下readRDS()R 中的函数尝试加载包/命名空间?我很惊讶在新的R会议中看到以下内容:

> loadedNamespaces()
[1] "base"      "datasets"  "graphics"  "grDevices" "methods"   "stats"    
[7] "tools"     "utils"    
> x <- readRDS('../../../../data/models/my_model.rds')
There were 19 warnings (use warnings() to see them)
> loadedNamespaces()
 [1] "base"         "class"        "colorspace"   "data.table"  
 [5] "datasets"     "dichromat"    "e1071"        "earth"       
 [9] "evaluate"     "fields"       "formatR"      "gbm"         
[13] "ggthemes"     "graphics"     "grDevices"    "grid"        
[17] "Iso"          "knitr"        "labeling"     "lattice"     
[21] "lubridate"    "MASS"         "methods"      "munsell"     
[25] "plotmo"       "plyr"         "proto"        "quantreg"    
[29] "randomForest" "RColorBrewer" "reshape2"     "rJava"       
[33] "scales"       "spam"         "SparseM"      "splines"     
[37] "stats"        "stringr"      "survival" …
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

serialization r

9
推荐指数
1
解决办法
1002
查看次数

/anaconda3/bin/conda 和 /anaconda3/condabin/conda 之间的区别

内壳时

which conda
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我明白了

/anaconda3/bin/conda
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

在 tmux 里面我得到

/anaconda3/condabin/conda
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

有人知道我的配置有什么区别或有问题吗?

tmux anaconda

9
推荐指数
1
解决办法
4343
查看次数

雅虎BOSS V2授权麻烦

雅虎的身份验证/授权非常困难.我在我的帐户中启用了BOSS,设置了付款方式,现在我正在尝试使用一些python代码运行搜索:

import urllib2
import oauth2 as oauth
import time

OAUTH_CONSUMER_KEY = "blahblahblah"
OAUTH_CONSUMER_SECRET = "blah"

def oauth_request(url, params, method="GET"):
    params['oauth_version'] = "1.0",
    params['oauth_nonce'] = oauth.generate_nonce(),
    params['oauth_timestamp'] = int(time.time())

    consumer = oauth.Consumer(key=OAUTH_CONSUMER_KEY,
                              secret=OAUTH_CONSUMER_SECRET)
    params['oauth_consumer_key'] = consumer.key
    req = oauth.Request(method=method, url=url, parameters=params)
    req.sign_request(oauth.SignatureMethod_HMAC_SHA1(), consumer, None)

    return req


if __name__ == "__main__":
    url = "http://yboss.yahooapis.com/ysearch/web"

    req = oauth_request(url, params={"q": "cats dogs"})
    req_url = req.to_url()
    print req_url
    result = urllib2.urlopen(req_url)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我一直有urllib2.HTTPError: HTTP Error 401: Unauthorized例外.我无法弄清楚我的密钥或签名方法是否有问题,或者我是否在签署后以某种方式篡改我的数据,或者交易是什么.有人有建议吗?

python yahoo oauth

8
推荐指数
2
解决办法
2464
查看次数

R中的物理常数

只是好奇 - 是否有包含物理常数值的包或数据集?我只是问,因为我现在输入273.15了几次(Celsius到Kelvin转换)错误.=)

r constants units-of-measurement

8
推荐指数
2
解决办法
1511
查看次数

动态计算参数值

当我将参数传递给#+begin_src块时,有没有办法动态计算它们?

具体来说,我想将:height属性设置为依赖于我的R代码中的一些变量的东西,如下面的模型:

#+begin_src R
x <- 5
#+end_src

#+begin_src R :results graphics :file foo.svg :height (3*getvar('x'))
...draw picture here
#+end_src
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

那个getvar()东西,以及那些计算,也许是我的一厢情愿的想法.

emacs r org-mode

8
推荐指数
1
解决办法
196
查看次数

在R中滑动FFT

R中是否有函数或包用于计算样本的滑动FFT?我的意思是,给定输出fft(x[n:m]),fft(x[1+(n:m)])有效地计算.

理想情况下,我会找到一个在线版本(我在开始时无法访问全时系列,或者它太大而无法放入内存中,我不会尝试将整个运行的FFT保存在内存或者是批处理版本(我给它整个样本x并告诉它运行的窗口宽度w,产生一个复杂的维度矩阵c(w,length(x)/w)).

这里给出了这种算法的一个例子(但我从未试过用任何语言实现它):

http://cnx.org/content/m12029/latest/

如果R中已经没有这样的东西,那我觉得实现起来并不难.

r fft

8
推荐指数
1
解决办法
642
查看次数

从条件公式中提取信息

我想编写一个R函数,它接受一个公式作为它的第一个参数,类似于lm()或glm()和朋友.在这种情况下,它是一个获取数据框并以SVMLight格式写出文件的函数,它具有以下通用形式:

<line> .=. <target> <feature>:<value> <feature>:<value> ... <feature>:<value> # <info>
<target> .=. +1 | -1 | 0 | <float> 
<feature> .=. <integer> | "qid"
<value> .=. <float>
<info> .=. <string>
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

例如,以下数据框:

  result qid     f1     f2     f3     f4   f5     f6     f7     f8
1     -1   1 0.0000 0.1253 0.0000 0.1017 0.00 0.0000 0.0000 0.9999
2     -1   1 0.0098 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0.0316 0.0000 0.3661
3      1   1 0.0000 0.0000 0.1941 0.0000 0.00 0.0000 0.0509 0.0000
4     -1 …
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

r formula

7
推荐指数
1
解决办法
775
查看次数

SWeave与非R代码块?

我经常使用Sweave生成LaTeX文档,其中通过执行R代码动态生成某些块.这很好用 - 但是也可以使代码块以不同的方式执行,例如通过在shell中执行代码,或者运行Perl,依此类推?能够混合起来会很有帮助,所以我可以做一些事情,比如运行一些shell命令来获取一些数据,运行一些perl命令来预处理它,然后运行R命令来分析它.

当然,我可以使用所有R块并system()用作穷人的替代品,但这并不能使文档中的阅读非常愉快.

shell r sweave

7
推荐指数
2
解决办法
633
查看次数

润滑间隔的长度

以指定单位表示以intervalin 表示的时间长度的最佳方法是什么lubridate?我能弄明白的就是下面这个混乱的东西:

> ival
[1] 2011-01-01 03:00:46 -- 2011-10-21 18:33:44

> difftime(attr(ival, "start") + as.numeric(ival), attr(ival, "start"), 'days')
Time difference of 293.6479 days
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

(我还在https://github.com/hadley/lubridate/issues/105上添加了这个功能请求,假设没有更好的方法可用 - 但也许有人知道一个.)

更新 - 显然该difftime功能也无法处理.这是一个例子.

> (d1 <- as.POSIXct("2011-03-12 12:00:00", 'America/Chicago'))
[1] "2011-03-12 12:00:00 CST"
> (d2 <- d1 + days(1))  # Gives desired result
[1] "2011-03-13 12:00:00 CDT"
> (i2 <- d2 - d1)
[1] 2011-03-12 12:00:00 -- 2011-03-13 12:00:00 
> difftime(attr(i2, "start") + as.numeric(i2), attr(i2, "start"), …
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

r lubridate

7
推荐指数
2
解决办法
9013
查看次数