小编use*_*785的帖子

我知道这似乎微不足道,但由于某种原因,我无法弄清楚如何做到这一点.

我已经制作了这个情节

使用这些命令:

data1 <- read.table("data_for_question.txt", sep="\t", header=TRUE)
plot(data1, type="l", lwd=2)

从数据我将在下面添加.

这是一个很好的情节,但刻度线和数字相距太远.我想在每个第4个数据点都有一个刻度标记,它将以20,000个时间点的增量,而不是如此处所示的50,00.

我为长长的数据列表道歉,但绘制的数据点数似乎与我在刻度标记中的问题有关.

谢谢!

我知道这似乎是重复的,但我已经检查了几个小时,其他类似的问题,并且由于某些原因,没有一个解决方案适合我.

数据:

Time    Counts
0   29
5000    68
10000   55
15000   34
20000   61
25000   47
30000   42
35000   39
40000   25
45000   3
50000   30
55000   2
60000   36
65000   29
70000   13
75000   13
80000   17
85000   11
90000   10
95000   29
100000  20
105000  8
110000  0
115000  1
120000  1
125000  1
130000  1
135000  0
140000  6
145000  0
150000 …

我想做一个相对简单的情节(让人想起如下的时间线:http://www.ats.ucla.edu/stat/sas/code/timeline.gif),但不是时间在x轴上,它将成为基因组中的基础位置."时间跨度"将是DNA序列支架的覆盖距离,显示它们落入基因组的范围,它们重叠的位置和没有覆盖的位置.这是我正在寻找的粗略模型,显示rRNA的重叠群覆盖,(我遗漏了,但需要,x轴显示开始和停止的位置,以及重叠群的标记(彩色线)): http://i.imgur.com/MDABx.png,具有以下坐标:

Contig# Start1  Stop1   Start2  Stop2   Start3  Stop3   Start4  Stop4
1   1   90  90  100 120 150 200 400
2   1   100 120 150 200 400 NA  NA
3   1   30  90  100 120 135 200 400
4   1   100 120 140 200 400 NA  NA
5   -35 80  90  100 130 150 200 400
6   1   100 200 300 360 400 NA  NA

我很确定这可以在R中完成,可能使用ggplot2,但由于某种原因我无法弄明白.