小编Run*_*ner的帖子

将数据框的列中的所有负值更改为零

在R中,如何将数据框列中的所有负值更改为零?是否有一个简单的功能可以与apply()这项工作一起使用?或者,如何编写循环来做到这一点?非常感谢你!

r

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计算文件中某个三联体的数量(DNA密码子分析)

这个问题实际上是用于DNA密码子分析,用简单的方式来说,假设我有一个这样的文件:
atgaaaccaaag ...
而且我想计算这个文件中存在的'aaa'三元组的数量.重要的是,三元组从一开始就开始(这意味着atg,aaa,cca,aag,......)因此在这个例子中结果应该是1而不是2'aaa'.
有没有Python或Shellscript方法来做到这一点?谢谢!

python shell bioinformatics

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如何解压缩文件夹中的所有.gz文件并将它们组合成一个新文件,而不为每个.gz文件生成未压缩的文件

我想解压缩文件夹中的所有.gz文件并将它们组合成一个新文件.我可以在不为每个.gz文件生成未压缩文件的情况下执行此操作吗?

非常感谢!

bash shell gzip

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请解释这个正则表达式

  ^[[:space:]]*@
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我无法弄清楚[[:space:]]*上面正则表达式的含义.请帮忙,谢谢!

regex perl

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如何将每三个字符放在一个新行上?

我有一个包含字符串的文件,例如:

ATCGGTCAA
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我需要在每三个字符后面添加一个新行,这样每行只出现三个字符,例如:

ATC
GGT
CAA
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

如何在shell中进行此转换?

string shell

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排序 - 如果某些列中缺少值,该怎么办?

我想使用SORT命令根据第5列对表格文件进行排序,但是,第3列中有一些缺失值.我注意到sort命令与-k5,5无法正常工作,但-k1,1或-k2,2没有问题.是因为缺少价值吗?

unix linux sorting bash

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