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我正在使用GenomicRange R包.我有一个像这样的输入文件:

dvex108056 + 87 206
dvex108056 + 87 226
dvex108056 - 101 240
dvex108056 - 104 240 
dvex108056 - 59 188
dvex108056 - 68 197
dvex108056 - 70 208
dvex108056 - 75 211
dvex108056 - 78 217
dvex108056 - 79 218
dvex108056 - 84 223
dvex108056 - 85 220
dvex108056 - 87 226
dvex108056 - 88 226
dvex108056 - 88 227
dvex108056 - 91 210
dvex108056 - 91 230
dvex114041 - 6255 6383
dvex144086 + 2557 2678
dvex144086 + …

我正在尝试在Cassandra上发出cqlsh请求。这个想法是分析来自基因组中不同“基因”寄存器的平均长度。输入数据后，我有以下athaliana.tab表：

 id                                   | chr | comments          | end      | orf | sense | start    | type
--------------------------------------+-----+-------------------+----------+-----+-------+----------+------
 d2ab2520-6734-11e5-955c-234085c1edec |   1 | gene_id AT1G16340 |  5590338 |   0 |     - |  5590241 |  CDS
 d4169c00-6734-11e5-955c-234085c1edec |   1 | gene_id AT1G16610 |  5676495 |   . |     - |  5676429 | exon
 a8c792c0-6734-11e5-955c-234085c1edec |   1 | gene_id AT1G07485 |  2301889 |   0 |     + |  2301665 |  CDS
 3bd5c0a0-6735-11e5-955c-234085c1edec |   1 | gene_id AT1G51980 | 19326916 |   . |     - | 19326733 | …