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我运行一个输出许多.vtk文件的代码.我可以使用哪些软件包来可视化这些VTK文件？

我有一些VTK文件,看起来像这样:

# vtk DataFile Version 1.0
Line representation of vtk
ASCII
DATASET POLYDATA
POINTS 30 FLOAT
234 462 35
233 463 35
231 464 35
232 464 35
229 465 35
[...]
LINES 120 360
2 0 1
2 0 1
2 1 0
2 1 3
2 1 0
2 1 3
2 2 5
2 2 3
[...]

我想从这些VTK文件中获取两个列表:edgesList和verticesList:

• edgesList应包含边((FromVerticeIndex,ToVerticeIndex,Weight)-tuples
• verticesList应包含顶点为(x,y,z)-tuples.索引是edgesList中提到的索引

我不知道如何使用standard-vtk-python库提取它.我到目前为止:

import sys, vtk

filename = "/home/graphs/g000231.vtk"

reader = vtk.vtkSTLReader()
reader.SetFileName(filename)
reader.Update()

idList = vtk.vtkIdList() 

polyDataOutput = …

我正在用wxPython和VTK创建一个应用程序.屏幕左侧有一个配置面板(wx.Panel),右侧有一个VTK窗口,也基于wx.Panel.将面板放置在wxFrame的boxsizer中,并使用wxFormBuilder应用程序中定义的比例大小调整大小,然后使用该大小来生成XRC文件.

我有一个非常具体的问题,一些Windows 7机器一直没有正确调整窗口的VTK部分 - 请参阅上面屏幕截图中VTK窗口周围的白色边框.我试图让这个VTK窗口固定为1280x720 - 它是 - 但是有一个尺寸问题,一些元素正在切断窗口的底部和右边.在Ubuntu 10.04,XP或Windows 7的某些版本上运行时,此错误不存在(我不确定那些有效的和那些尚未有效的内容是什么).

当遇到这个错误时,我可以与屏幕的白色部分进行交互 - 通过VTK交互器正确处理点击,因此它仍然是我的VTK场景的一部分.

应用程序设置如下,右侧VTK窗格是graphics_panel.面板设置为wxEXPAND没有其他标志,我的应用程序中的所有元素都自动设置为大小(没有设置最小,最大或默认大小).唯一的例外是bSizer1(主要的wxFrame sizer),它具有最小宽度和高度设置(我不确定这是否是正确的方法,但它似乎工作正常).

我从wxFormBuilder生成XRC,然后在我的应用程序中使用它,我的VTK场景设置如下:

class MyScene(wx.Panel):
    def __init__(self, parent):
        wx.Panel.__init__(self, parent, style=wx.NO_BORDER) 
        #'parent' is main_frame (wx.Frame instance)
        self._parent = parent
        self.renderer = vtk.vtkRenderer()

        # I create and add my VTK actors here (SNIPPED)

        self._set_lighting()

        self.widget = VTKWidget(self,-1) #VTKWidget is a wxVTKRenderWindowInteractor
        self.widget.GetRenderWindow().AddRenderer(self.renderer)
        self.widget.Enable(1)
        self.widget.SetDoubleBuffered(True)

        self.Bind(wx.EVT_SIZE, self.on_size)

我一直在尝试解决使用该on_size函数的元素大小的MyScene问题,但下面没有任何内容可以解决我的问题.报告的数值都正常的和错误的系统是符合市场预期.

def on_size(self, evt):
    print "---- MyScene on_size ----"
    print "Widget …

您好我试图在Windows 8下使用CMake编译VTK和ITK.ITK编译完美,但当我尝试通过CMake处理VTK时,我得到错误cmTryCompileExec has stopped working.我怎么解决这个问题？我的CMake版本是2.8.12.1

我有一组存储在VTK文件中的数据,它代表一个带有数组中标量点数据的域的切割.我正在尝试生成所述标量的等高线图,使其看起来有点像使用ParaView制作的附图.我宁愿坚持使用vtk库而不是使用其他东西,比如Matplotlib,因为我认为它们会产生更好的可视化效果..

我在网上看过几个例子,但没有一个对我有效(没有错误被抛出,我最终得到的只是背景的空渲染),所有我能做的就是表面图数据(例如:这里).

这是我所拥有的代码的当前版本(非常类似于成功生成曲面图的代码):

# import data
reader = vtk.vtkDataSetReader()
reader.SetFileName('inputDataFiles/k_zCut.vtk')
reader.ReadAllVectorsOn()
reader.ReadAllScalarsOn()
reader.Update()

# access data
data = reader.GetOutput()
d = data.GetPointData()
array=d.GetArray('k')

# create the filter
contours = vtk.vtkContourFilter()
contours.SetInput(reader.GetOutput())
contours.GenerateValues(5,1.,5.)

# create the mapper
mapper = vtk.vtkPolyDataMapper()
mapper.SetInput(contours.GetOutput())
mapper.ScalarVisibilityOff()
mapper.SetScalarRange(1., 5.)

# create the actor
actor = vtk.vtkActor()
actor.SetMapper(mapper)

# create a rendering window and renderer
ren = vtk.vtkRenderer()
ren.SetBackground( 0.329412, 0.34902, 0.427451 ) #Paraview blue

# Assign actor to the renderer
ren.AddActor(actor)

renWin = …

我在远程服务器上有一个.vtk文件.我通过http访问它(我验证了文件的URL是正确的,实际上我可以从浏览器下载它).我也尝试使用matlab创建的.vtk文件中的xtk体积渲染中的建议删除文件中的空格.

但我得到一个例外

Unable to get property 'length' of undefined or null reference.

你能否指导一下应该使用的.vtk文件格式,以使其顺利运行？我正在关注xtk教程http://jsfiddle.net/gh/get/toolkit/edge/xtk/lessons/tree/master/05/#run,下面是我的代码

window.onload = function () {

    // create and initialize a 3D renderer
    var r = new X.renderer3D();
    r.init();

    // create a new X.mesh
    var skull = new X.mesh();
    // .. and associate the .vtk file to it
     skull.file = 'http://localhost/startup/bunnycheck.vtk';  //using other .vtk file
    //skull.file = 'http://x.babymri.org/?skull.vtk';     

    // .. make it transparent
    skull.opacity = 0.5;

    // .. add the mesh
    r.add(skull); …

我试图用python和python-vtk处理MHD图像文件.该文件放在谷歌驱动器:mhd.

我想将它转换为numpy数组,然后根据给定的值"500例如"分割它们.然后计算摘要信息.我按照这个
[post]的说明如何将3D vtkDataSet转换为numpy数组？
但它对我的情况不起作用.

import vtk
imageReader = vtk.vtkMetaImageReader()
imageReader.SetFileName(testfile1)
imageReader.Update() 
# from vtk.util.numpy_support import numpy_to_vtk, vtk_to_numpy does not work for the data type issue

image = imageReader.GetOutput()
# List the dimensions of the image, for example
print image.GetDimensions()
pixelspace = imageReader.GetPixelSpacing()

这里出现错误:

AttributeError: GetPixelSpacing

我怎么能实现转换？
当我完成数据拆分时,我怎么能将它们保存回mhd(或原始数据会更好？)

在没有令人满意的第一个答案和无法解释的降票后进行编辑：

import numpy as np
from mayavi import mlab

dt = 10
X,Y,Z = np.mgrid[0:dt,0:dt,0:dt]

F = X**2+Y**2+Z**2

test = mlab.figure(size = (1024,768), bgcolor = (1,1,1), fgcolor = (0, 0, 0))
sf = mlab.pipeline.scalar_field(X,Y,Z,F)
vl = mlab.pipeline.volume(sf)
mlab.outline()
mlab.axes()
mlab.title('Can not change font size for this title')
mlab.xlabel('Only end ticks')
mlab.ylabel('No major ticks')