标签: violin-plot

所以我遵循这个 ggplot2 小提琴图指南： http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-violin-plot-quick-start-guide-r-software-and-data-visualization

我正在使用mean_sdl函数，尝试将汇总统计数据添加到我的小提琴图中。代码运行得很好，但我收到错误“警告：忽略未知参数：mult”。这是代码：

> p<-ggplot(TG, aes(x=dose, y=len)) + geom_violin(trim=FALSE)
> p + stat_summary(fun.data="mean_sdl", mult=1, geom="crossbar", width=0.1)
Warning: Ignoring unknown parameters: mult
> p + stat_summary(fun.data=mean_sdl, mult=2, geom="pointrange", color="red")
Warning: Ignoring unknown parameters: mult

其中 mult 是与标准差相乘的因子，它会生成绘制的四分位数或范围的长度。有谁知道为什么会发生这种情况？我在网上找不到任何东西。此人的示例中也不断出现相同的错误：

（例如https://ropensci.github.io/plotly/ggplot2/stat_summary.html）

d + stat_sum_df("mean_sdl", mult = 1, mapping = aes(group = cyl))

Error: Unknown parameters: mult

我想绘制一个小提琴 ggplot，其中 x 轴是年份，y 轴是值。每年，我都需要三个小提琴图。当我尝试这样做时，y 轴没有堆叠在一起，因此这三个轴的密度没有清楚地显示。每年，我希望它们绘制在相同的 y 轴上，并且填充颜色是透明的，以便所有三个都可以看到。该数据集相当长（很难复制较短的数据集），但它是sum1.14、sum5.14和的三个数据帧sum10.14。

plot.density.tenor <- function(cent_list_sum1,cent_list_sum5,cent_list_sum10,start_year,end_year){
  df1 <- melt(ldply(cent_list_sum1, data.frame))
  df5 <- melt(ldply(cent_list_sum5, data.frame))
  df10 <- melt(ldply(cent_list_sum10, data.frame))
  df <- rbind(df1,df5,df10)
  years <- seq(start_year,end_year)
  df$year <- rep(rep(as.character(seq(start_year,end_year)),each=nrow(df1)/length(years)),3)
  df$tenor <- rep(c("1","5","10"),each=nrow(df1))
  df$tenor <- factor(df$tenor, levels=c("1", "5", "10"))
  ggplot(df, aes(year, value, color = tenor)) + 
    geom_flat_violin() +
    ggtitle("Centrality Measure Distribution") + ylab("Centrality") + xlab("Year") +
    stat_summary(colour="red", size = 0.5)
    #theme(legend.position = "none")
}
plot.density.tenor(sum1.14,sum5.14,sum10.14,2010,2021)

使用http://seaborn.pydata.org/ generated/seaborn.violinplot.html 上的示例：

import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", data=tips)

_{（来源：pydata.org）}

如何在每把小提琴的顶部绘制两条小水平线（例如指示分布的 2.5 百分位数和 97.5 百分位数的误差线上限？

我使用以下代码创建了雨云图：

#雨图

dx = 'Time Point'; dy = 'Score'; ort = "v"; pal = "Set2"; sigma = .2; 

f, ax = plt.subplots(figsize=(7, 5))

pt.RainCloud(x = dx, y = dy, data = df, palette = pal, bw = sigma,
             width_viol = .9, ax= ax, orient = ort, move = .2)

plt.title("")
plt.ylabel('Score', fontsize = 20) 
plt.xlabel('', fontsize = 20) 
plt.grid(color = 'w')

if savefigs: 
    plt.savefig('/Users/zeidanlab/Desktop/gv/rainplots/figure_tsc.png', bbox_inches='tight')

雨云图

我想知道是否有办法使箱线图与分布斑点重叠。