标签: shiny-server

我在发布这个闪亮的应用程序时遇到了一些问题。对于我的问题，我认为 ui.R 不相关。这是服务器.R：

library(shiny)
library(RMySQL)
library(tidyverse)
library(colorspace)
library(ggplot2)

###     CONNECT AND QUERY THE DATABASE

### uncomment the next line to reconnect to server & re-query the database

source("http://www.mvabl.com/Dashrock/MySQL_connect_query.R")

con <- dbConnect(MySQL(),
    user = 'shiny_apps',
    password = '####',
    host = 'mysql.mvabl.com',
    dbname='sandbox191')

qmain <- dbSendQuery(con, "SELECT * FROM sizes;")

sizes <- as.data.frame(dbFetch(qmain,n=-1),na.rm=TRUE)

###     GENERATE GGPLOT

colors17 <- c("#9D8FAC","#8E96B0","#7F9BB0","#71A0AD","#67A5A7","#63A89E","#64AB94","#6BAC88","#77AD7B","#85AD70","#94AC66","#A4AA5F","#B5A75B","#C4A35B","#D39F5F","#DF9C67","#E99872")

colors6 <- c("#9D8FAC","#6FA1AC","#66AB8F","#8EAC6A","#C1A45A","#E99872")

sizes$Size_Cat <- factor(sizes$Size_Cat,
                         levels = c("n1_4","n5_9","n10_19",
                                    "n20_49","n50_99","n100_249",
                                    "n250_499","n500_999","n1000",
                                    "n1000_1","n1000_2","n1000_3",
                                    "n1000_4"))
sizes$market <- factor(sizes$market,
                         levels = c("NYC","LA","CHI","DC","SF","BOS"))
sizes <- sizes %>% …

我正在尝试使用 Letscrypt 的 SSL 证书配置 Shiny Server Pro。我按照以下命令创建证书，如下所述： https: //certbot.eff.org/#ubuntuxenial-other

sudo apt-get install letsencrypt
sudo systemctl stop shiny-server
letsencrypt certonly --standalone -d pbisny.org -d www.pbisny.org

我将此行添加到/etc/shiny-server/shiny-server.conf

 ssl /etc/letsencrypt/live/pbisny.org/privkey.pem /etc/letsencrypt/live/pbisny.org/cert.pem

并启动服务器。

sudo systemctl start shiny-server

然后我得到这个错误：

Job for shiny-server.service failed because a configured resource limit
was exceeded. See "systemctl status shiny-server.service" and
"journalctl -xe" for details.

以下是详细信息systemctl status shiny-server.service

shiny-server.service - ShinyServer
   Loaded: loaded (/etc/systemd/system/shiny-server.service; enabled; vendor preset: enabled)
   Active: failed (Result: resources) since Sat 2016-10-22 12:29:19 UTC; 9s …

我有一个downloadHandler内置的闪亮应用程序，它适用于较小的数据集，但是当文件变大 (330 MB) 时，它会超时并出现错误。

我发现这个 SO 问题（闪亮的 downloadHandler timeout）似乎解决了答案，尽管我不知道如何更新配置文件以考虑http_keepalive_timeout。

下面是我的配置文件：

# Instruct Shiny Server to run applications as the user "shiny"
run_as shiny;


# Define a server that listens on port 3838
server {
  listen 3838;

  # Define a location at the base URL
  location / {

    # Host the directory of Shiny Apps stored in this directory
    site_dir /srv/shiny-server;

    # Log all Shiny output to files in this directory
    log_dir /var/log/shiny-server;

    # When …

我有一个简单的闪亮应用程序，它从data文件夹加载数据并生成一个交互式绘图。我对我闪亮的应用程序进行了docker化。我将data文件夹放在容器中。dockerized 应用程序可以在我的本地主机上成功部署。这是我的global.r文件：

library(shiny) 
library(dplyr)
df = readRDS('./data/mydata.rds')

最终我需要闪亮的应用程序从外部文件夹加载数据。所以我global.r像这样改变了我的文件：

library(shiny) 
library(dplyr)
df = readRDS('c:/user/document/data/mydata.rds')

在这里，我希望应用程序从本地驱动器上的文件夹之一加载数据。c:/user/document/data/. 该应用程序可以完美运行。但是在我将它docker化并尝试在本地主机上运行docker镜像之后。它失败了！

我似乎应用程序无法连接到 docker 容器之外的文件夹？我是 docker 新手。我糊涂了....

有谁知道如何使闪亮的应用程序连接并从 docker 容器外的文件夹加载数据？来自本地驱动器上的文件夹或共享点文件夹或....？非常感谢！

有没有办法在不将文件上传到 R Shiny 的情况下“查看”​​文件大小？

我有一个闪亮的网络应用程序。我想创建一个 downloadButton，单击该按钮即可下载 PowerPoint 文件。我需要在 downloadHandler 函数中添加什么才能从某个文件路径读取 PowerPoint 文件，然后将该文件下载给按下按钮的用户？

当我在 RStudio 上运行闪亮的应用程序时，我的应用程序会运行并且 URL 如下所示：

Listening on http://127.0.0.1:4991

但每次我再次运行该应用程序时，端口都会发生变化，我想知道是否有一种方法可以将 url 作为变量或类似的东西获取。我的意思是，每次运行应用程序时，我都想获取 URL 并将其保存在变量中。

谢谢

不知道这是否是发布此问题的最佳地点，否则请向我指出正确的方向。

按照这些指令- https://aws.amazon.com/blogs/big-data/running-r-on-aws/ -我已经成功地推出了R，RStudio服务器和闪亮的服务器上的AWS EC2（亚马逊的Linux AMI）实例。初始化实例时，如说明所示，我通过在用户数据中添加代码行来创建用户和密码。

从主目录切换到实例后，我将具有以下内容：

[ec2-user@ip-012-34-56-78 home]$ ls
ec2-user  johndoe  shiny

我可以CD进入ec2-user目录，但是当我尝试CD进入johndoe目录时，出现以下错误：

[ec2-user@ip-012-34-56-78 home]$ cd johndoe/
-bash: cd: johndoe/: Permission denied

有人知道我如何进入该目录吗？我链接到的文章没有提及。

谢谢！