我想使用ALTER TABLE和UPDATE语句添加一个列到我的表,而不是重新创建完整的表.
在我的UPDATE语句中使用子查询时,我没有得到我期望的输出.
建立可重复的数据
library(dplyr)
library(dbplyr)
library(DBI)
con <- DBI::dbConnect(RSQLite::SQLite(), path = ":memory:")
copy_to(con, iris[c(1,2,51),],"iris")
tbl(con,"iris")
# # Source: table<iris> [?? x 5]
# # Database: sqlite 3.19.3 []
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
# <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <chr>
# 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
# 2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
# 3 7.0 3.2 4.7 1.4 versicolor
在单独的表中创建新列
DBI::dbSendQuery(con, "CREATE TABLE new_table AS SELECT t2.new_col from
iris t1 inner …我无法列出我从 R 连接到的 sqlite 数据库的表。
我使用“数据库浏览器” https://sqlitebrowser.org/在数据库 (WBS_test1.db) 中设置表
在命令窗口中查看此数据库，我可以通过 .tables 列出表并通过 .schema 查看数据标头，因此我知道它们是（当然也可以在数据库浏览器中预览）。
然而，在 R 中...，我设置了我的工作目录等。
library(DBI)
library(RSQLite)
setwd(dir = "C:/here/there/folder")
sqlite <- dbDriver("SQLite")
然后，我连接到数据库并尝试专门列出其中一个表中的表和字段
DBtest <- dbConnect(sqlite,"WBS_Test1.db")
dbListTables(DBtest)
dbListFields(DBtest, "WBS_CO2")
我得到一个返回的“字符（0）”，从周围搜索看来，它表明这些表是临时的。
我也尝试过使用 dplyr 包
library(dplyr)
# connect to the sqlite file
test_db <- src_sqlite("C:/SQLite/WBS_test.db", create = TRUE)
src_tbls(test_db)
这再次返回一个“字符（0）”
我之前没有使用 SQLite 的经验，也没有使用 R 的经验，所以我可能错过了一些简单的东西，但我无法弄清楚。建议？？？也许我没有将 wd 定向到 RSQLite 包的正确位置？
谢谢！
我有几个大型 R data.frames，我想将它们放入本地 duckdb 数据库中。我遇到的问题是 duckdb 似乎将所有内容加载到内存中，即使我指定一个文件作为位置。
另外，我不清楚建立连接的正确方法（所以我不确定这是否与此有关）。我努力了：
duckdrv <- duckdb(dbdir="dt.db", read_only=FALSE)
dkCon <- dbConnect(drv=duckdrv)
并且：
duckdrv <- duckdb()
dkCon <- dbConnect(drv=duckdrv, dbdir="dt.db", read_only=FALSE)
两者都工作正常，这意味着我可以创建表、使用 dbWriteTable、运行查询等。但是，内存使用量非常高（与 data.frames 的大小大约相同）。我想我在某处读到，duckdb 默认使用一定百分比的可用内存，这对我来说不起作用，因为我使用的系统是共享资源。我还想并行运行一些查询，这将导致内存使用量更高。
我已经尝试过这个：
dbExecute(dkCon, "PRAGMA memory_limit='1GB';")
但这似乎没有什么区别，即使我关闭连接，关闭实例并重新连接。
有谁知道我该如何解决这个问题？当我将数据写入表时，RSQLite 也暂时具有较高的内存使用率，但随后它会恢复正常，如果我打开只读连接，则根本不是问题。我想让 duckdb 工作，因为我认为查询应该更快。任何帮助，将不胜感激！
我正在使用RSQLiteR in中的库来管理对RAM来说太大的数据集.对于每个回归,我查询数据库以一次检索一个会计年度.现在我有财政年度的硬编码:
data.annual <- dbGetQuery(db, "SELECT * FROM annual WHERE fyear==2008")
我想让财政年度(2008年上面)让变更更容易(并且万无一失).有没有办法可以将变量传递给SQL查询字符串？我很乐意使用:
fiscal.year <- 2008
data.annual <- dbGetQuery(db, "SELECT * FROM annual WHERE fyear==fiscal.year")
我正在尝试将我在 R 中生成的向量作为新列添加到 sqlite 表中。为此，我想使用dplyr（dbplyr根据此处的这篇文章，我安装了最新的开发版本以及软件包）。我试过的：
library(dplyr)
library(DBI)
#creating initial database and table
dbcon <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), "cars.db")
dbWriteTable(dbcon, name = "cars", value = cars)
cars_tbl <- dplyr::tbl(dbcon, "cars")
#new values which I want to add as a new column
new_values <- sample(c("A","B","C"), nrow(cars), replace = TRUE)
#attempt to add new values as column to the table in the database
cars_tbl %>% mutate(new_col = new_values) #not working
实现这一目标的简单方法是什么（不一定使用 dplyr）？
我正在使用 R 包 dbplyr 创建一个数据库，使用 RSQLite，但我的数据库在磁盘上的大小为零字节，尽管我写了（和读回）了一个表。这是我的脚本：
library("RSQLite")
library("dbplyr")
library("dplyr")
data(mtcars)
con <- DBI::dbConnect(RSQLite::SQLite(), dbname = "./mtcars.db")
copy_to(con, mtcars, "mtcars")
print(tbl(con, "mtcars"))
但是正如你从最后的 ls -l 看到的，我的数据库大小是 0，即使脚本确实从数据库中读取了 mtcars（所以它在那里）。我想使用数据库文件与另一个程序共享数据，那么如何定期将数据“刷新”到磁盘？
tbrowne@calculon:~/scratch$ R -f dplysqlite.r
R version 3.2.3 (2015-12-10) -- "Wooden Christmas-Tree"
Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.
Natural language support but …我正在尝试为 SQLite 数据库创建一个带有主键的表。有没有办法用 DBI 来做到这一点？我查看了文档，但看不到任何示例。我正在尝试类似下面的例子。
library(DBI)
library(RSQLite)
conn <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), "")
DBI::dbCreateTable(conn, "mytable", c(a = "integer", b = "text"), 'PRIMARY KEY("a")')
dbDisconnect(conn)
我在用 bioconductor 安装 biomaRt 时遇到问题。我已经使用 R 3.6 在 Rstudio 中安装了这个包而没有错误，但是在 conda 特定环境容器中使用 R 4.0，我在使用 RSQLite 时出现错误。
这里是这个消息：
x86_64-conda-linux-gnu-c++ -std=gnu++11 -I"/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/lib/R/include" -DNDEBUG -I. -Ivendor -DRSQLITE_USE_BUNDLED_SQLITE -DSQLITE_ENABLE_RTREE -DSQLITE_ENABLE_FTS3 -DSQLITE_ENABLE_FTS3_PARENTHESIS -DSQLITE_ENABLE_FTS5 -DSQLITE_ENABLE_JSON1 -DSQLITE_ENABLE_STAT4 -DSQLITE_SOUNDEX -DRCPP_DEFAULT_INCLUDE_CALL=false -DRCPP_USING_UTF8_ERROR_STRING -DBOOST_NO_AUTO_PTR -DSQLITE_MAX_LENGTH=2147483647 -DHAVE_USLEEP=1 -I'/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/lib/R/library/plogr/include' -I'/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/lib/R/library/Rcpp/include' -DNDEBUG -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O2 -isystem /home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/include -I/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/include -Wl,-rpath-link,/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/lib -fvisibility=hidden -fpic -fvisibility-inlines-hidden -fmessage-length=0 -march=nocona -mtune=haswell -ftree-vectorize -fPIC -fstack-protector-strong -fno-plt -O2 -ffunction-sections -pipe -isystem /home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/include -fdebug-prefix-map=/home/conda/feedstock_root/build_artifacts/r-base-split_1616773775410/work=/usr/local/src/conda/r-base-4.0.3 -fdebug-prefix-map=/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base=/usr/local/src/conda-prefix -c SqliteColumnDataSource.cpp -o SqliteColumnDataSource.o
In file included from vendor/boost/math/special_functions/sign.hpp:16,
from vendor/boost/lexical_cast/detail/inf_nan.hpp:34,
from vendor/boost/lexical_cast/detail/converter_lexical_streams.hpp:63,
from vendor/boost/lexical_cast/detail/converter_lexical.hpp:54,
from vendor/boost/lexical_cast/try_lexical_convert.hpp:44,
from …我是 RSQLite 新手。我有一个文本格式的输入文档，其中值由“|”分开 我创建了一个包含所需变量的表（虚拟代码如下）
db<-dbconnect(SQLite(),dbname="test.sqlite")
dbSendQuery(conn=db,
"CREATE TABLE TABLE1(
MARKS INTEGER,
ROLLNUM INTEGER
NAME CHAR(25)
DATED DATE)"
)
然而，我对如何将值导入到创建的表中感到震惊。我无法使用 INSERT INTO Values 命令，因为原始数据文件中有数千行和 20 多列，并且不可能手动输入每个数据点。
有人可以建议一种替代的有效方法吗？
我需要检查我的resfromdbSendQuery()是否结束。
我的代码是这样的：
db <- dbConnect(drv=SQLite(),flags=SQLITE_RW,dbname="db.sqlite",synchronous = "off")
dbBegin(db)
res <- dbSendQuery(db,"Update Operation SET Name = 'teste' where Id = 1")
if("my SendQuery is over"){
dbClearResult(res)
dbCommit(db)
dbDisconnect(db)
}
我需要知道什么时候结束才能将其发送到提交然后断开连接。
更新 1 我是我的系统，对于上面的示例，可能会同时发生超过 1 个用户。然后，当数据库中的第一个连接结束时，我需要完成他的请求并为其他连接提供编写查询的可能性。