我有一些看起来像这样的txt文件(它们包含DNA序列和样本代码):
>SRR1502445.1
GACTACACGTAGTATACGAGTGCGTTCCTGCGCTTATTGATATGCTTAAGTTCAGCGGGTAGTCTCACCCGATTTGAGGTCAAGGTTTGTGGGTCGAGTCACAACTCGAACATCGTCTTTGTACAAAGACGGTTGGAAGCGGGTTCCAAGGCAACACAGGGGGATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
>SRR1502445.2
GACTACACGTAGTATACGAGTGCGTTCCTGCGCTTATTGATATGCTTAAGTTCAGCGGGTAGTCTCACCCGATTTGAGGTCAAGGTTTGTGGGTCGAGTCACAACTCGAACATCGTCTTTGTACAAGACGGTTGGAAGCGGGTTCCAAGGCACACAGGGGATAGGNNN
>SRR1502445.3
GACTACACGTAGTATACGAGTGCGTTCCTGCGCTTATTGATATGCTTAAGTTCAGCGGGTAGTCTCACCCGATTTGAGGTCAAGGTTTGTGGGTCGAGTCACAACTCGAACATCGTCTTTGTACAAAGACGGTTGGAAGCGGGTTCCAAGGCACACAGGGGATAGGNNN
>SRR1502445.4
GACTACACGTAGTATACGAGTGCGTTCCTGCGCTTATTGATATGCTTAAGTTCAGCGGGTAGTCTCACCCGATTTGAGGTCAAGGTTTGTGGGTCGAGTCACAACTCGAACATCGTCTTTGTACAAAGACGGTTGGAAGCGGGTTCCAAGGCACACAGGGGATAGGNNNNNNNNNNN
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我想删除文件中每隔一行的前15个字符.这将从GACTACACGTAGTAT第二行,第四行,第六行,第八行(等)中删除字符串.
例如,cut命令可以删除每行的前15个字符:
cut -c 1-15 /path/to/file.txt
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
从第二行开始,我只想申请其他每一行.
我正在尝试QIIME2 virtual machine在 macbook 上运行以下命令,但代码不起作用
validate_mapping_file.py -m Fasting_Map.txt -o mapping_output
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这是链接:http : //qiime.org/tutorials/tutorial.html
我收到以下消息
bash:validate_mapping_file.py:找不到命令
我unix/linux对qiime. 我将非常感谢您的帮助...