标签: pyvis

我想使用最新版本的 pyvis 和 python 版本 3.9.6 进行网络可视化：

from pyvis.network import Network
g = Network()
g.add_node(0)
g.add_node(1)
g.add_edge(0, 1)
g.show('test.html')

每次执行时g.show()我都会收到此错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/tom/Library/Mobile Documents/com~apple~CloudDocs/Projekte/Coding_/f1 standings/test2.py", line 3, in <module>
    g.show('nx.html')
  File "/Users/tom/Library/Python/3.9/lib/python/site-packages/pyvis/network.py", line 546, in show
    self.write_html(name, open_browser=False,notebook=True)
  File "/Users/tom/Library/Python/3.9/lib/python/site-packages/pyvis/network.py", line 515, in write_html
    self.html = self.generate_html(notebook=notebook)
  File "/Users/tom/Library/Python/3.9/lib/python/site-packages/pyvis/network.py", line 479, in generate_html
    self.html = template.render(height=height,
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'render'

我尝试更新 pyvis，更改了代码中的各种详细信息，并导入了所有 pyvis.network，但没有任何结果。

我已阅读文档，并且确实添加了具有属性的边weight，但边的权重未显示在绘图上，并且当我将诅咒悬停在两个节点之间的链接上时，边的权重也不会显示。可以显示体重吗？

代码片段（来源：https://pyvis.readthedocs.io/en/latest/tutorial.html#networkx-integration）：

from pyvis.network import Network
import networkx as nx

nx_graph = nx.cycle_graph(10)
nx_graph.nodes[1]['title'] = 'Number 1'
nx_graph.nodes[1]['group'] = 1
nx_graph.nodes[3]['title'] = 'I belong to a different group!'
nx_graph.nodes[3]['group'] = 10
nx_graph.add_node(20, size=20, title='couple', group=2)
nx_graph.add_node(21, size=15, title='couple', group=2)
nx_graph.add_edge(20, 21, weight=5)
nx_graph.add_node(25, size=25, label='lonely', title='lonely node', group=3)
nt = Network('500px', '500px')
# populates the nodes and edges data structures
nt.from_nx(nx_graph)
nt.show('nx.html')

结果： 片段的结果

如何显示边的权重？在此示例中，节点 20 和 21 的边有权重。

我正在寻找一种方法将 pyvis 生成的巨大图形导出为矢量图形 .svg 或至少 .png 格式。有办法做到吗？到目前为止，我只找到了保存/导出为 .html 文件的选项。

提前致谢。

我正在尝试用 pyvis 绘制一个定向图。在文档中，他们建议使用以下命令来创建定向边缘：

net.add_edge(4,1,from=1,to=4)

问题有两个：

1. 我收到这个错误

类型错误：add_edge() 获得参数“to”的多个值

2. from是 python 关键字，因此不能用作参数。

有什么建议吗？

我正在使用 Pyvis 库通过 HTML 格式生成并显示 Jupyter Lab 内（在单元格中）的网络。我已成功创建该文件并在外部打开它（使用 Pyvissave_graph函数）。但是，当使用net.Network(notebook=True)Pyvis 的选项时，Jupyter 输出：

404：未找到。
您正在请求一个不存在的页面！

虽然终端（从我启动 Jupyter 的地方）输出：

404 GET /文件/文档/(Git)%20Projects/SimSalar/Jupyter%20Notebooks/TRIAL2.html?_xsrf=2%7C9665d25e%7Cbc3fea246105c6b3a9d39f6bbb10d512%7C1607563598&1609770942196 (: :1) 1.29ms 引用=http://localhost:8888/lab /tree/Documents/(Git)%20Projects/SimSalar/Jupyter%20Notebooks/Workshop%20Analysis.ipynb

来自 Pyvis 文档的获取此错误的代码非常简单：

import networkx as nx
from pyvis import network as net

g = net.Network(notebook=True)
nxg = nx.complete_graph(5)
g.from_nx(nxg)
g.show('TRIAL2.html')

需要澄清的是，HTML 文件的创建没有任何问题（因此可以在外部打开），问题在于在 JupyterLab 内（在单元格中）显示此文件。我已多次重新安装 Jupyter，并使用了多个版本的 Jupyter Lab（2.4；2.6；现在是 3.0）。我在下面留下了完整的 conda 环境规范。我还为g.show('TRIAL2.html')操作系统模块提供了不同的函数路径。然而，它仍然不起作用。

# Name                    Version                   Build  Channel
anyio                     2.0.2            py39h6e9494a_3    conda-forge
appnope                   0.1.2            py39h6e9494a_0    conda-forge
argon2-cffi               20.1.0           py39h5a22ff9_2    conda-forge
async_generator           1.10 …

我正在尝试使用 networkx 作为网络图来可视化数据。我的数据看起来很棒，但我想添加悬停和单击事件以显示其他信息。例如，可能有一个名为“纽约”的节点，单击时将在画布一侧显示一个小表格，其中提供了诸如有多少个城市、当前人口等信息。我目前正在将 pyviz 与 networkx 一起使用。就创建图表而言，这似乎非常简单，但对于我正在寻找的用户交互类型却不是那么简单。

我还尝试了 bokeh 和plotly，但是在工作时的单击和悬停功能上，使用networkx 实现起来并不是很简单。这是我的图表的样子。我的目标是展示系统之间的关系。

pyvis图

我正在尝试可视化一个大型网络，pyvis并面临两个问题：

1. 超长渲染
2. 网络不稳定，即节点移动太快，很难与这样的网络交互。

禁用物理有助于toggle_physics(False)加快渲染速度并使网络静态，但会消除布局设置。这就是禁用物理后的样子： 链接。正如您所看到的，该图很混乱并且没有结构。我想要做的是禁用物理但保留布局设置，即我希望我的图形看起来像普通网络（例如类似于 中的弹簧布局networkX），并考虑每个边的权重。有办法这样做吗？

到目前为止，我发现pyvis只有层次结构布局，这不是我需要的。我认为集成networkX布局可能会有所帮助，但我不知道如何做到这一点，因为networkX允许将布局设置为函数中的关键字参数nx.draw()，这与我的情况不兼容。这是我的代码，以防它有助于理解我的问题：

g = nx.Graph()
edges_cards = cards_weights_df.values.tolist()
g.add_weighted_edges_from(edges_cards)

net = Network("1000px", "1800px")
net.from_nx(g)
net.toggle_physics(False)
net.show("graph.html")

感谢您的帮助！

我有一个文本语料库，我想将其中的单词共现可视化为网络。为此，我创建了一个cooc_pd包含Source、Target和列的 pd 数据框Weight。前两个是节点，Weight指示这两个节点（单词）在一组 window_size 内出现的频率。

然后，我使用以下代码来绘制网络：

import networkx as nx
from pyvis.network import Network
import pandas as pd

G = nx.from_pandas_edgelist(cooc_pd, 
                            source = 'Source', 
                            target = 'Target',
                            edge_attr='Weight')

net = Network(notebook=True)
net.from_nx(G)
net.show("example.html")
 

如果我选择较低的权重包含阈值，则图中会显示许多连接。然而，在这种情况下，节点example.html不断移动并且解释很困难。有没有办法（除了增加阈值）使节点停止移动？

遇到这样的错误：本地cdn资源在jupyter-notebook中使用时在chrome/safari上有问题。它在使用 pyvis 库时出现。

net = Network(notebook=True)

net.add_nodes(
    [1, 2, 3, 4, 5],  # node ids
    label=['Node #1', 'Node #2', 'Node #3', 'Node #4', 'Node #5'],  # node labels
    # node titles (display on mouse hover)
    title=['Main node', 'Just node', 'Just node', 'Just node', 'Node with self-loop'],
    color=['#d47415', '#22b512', '#42adf5', '#4a21b0', '#e627a9']  # node colors (HEX)
)
net.add_edges([(1, 2), (1, 3), (2, 3), (2, 4), (3, 5), (5, 1)])

net.show('graph.html')

在此输入图像描述

我尝试将浏览器切换到 dataspell