标签: errorbar

我已经制作了一个图表,facet_grid用于显示每天每个治疗组中每个组中的litium百分比.

library(ggplot2)
library(Rmisc) 
library(plyr)

mus2 <- summarySE(mus, measurevar="litium", 
                         groupvars=c("treatment", "group", "day"), na.rm = TRUE)

mus2

mus3 <- mus2
mus3$group <- factor(mus3$group)

ms.chl<- ggplot(mus3, aes(x=group, y=litium, fill=treatment)) +
  geom_bar(stat="identity", colour="black") + facet_grid(~day) + theme_bw() 
ms.chl

结果如下:

为此我有两个问题:

我无法为litium内容PER GROUP制作正确的误差线.我试过这个,但每次治疗我只得到误差棒.

ms.chl + geom_errorbar(aes(ymin=litium-se, ymax=litium+se), size=0.5,   
        width=.25,                    
        position=position_dodge(.9)) +
facet_grid(~day)

我想从每组的总数中得到误差线

之后,我的第二个问题是:是否有可能代表每组的绝对值和每种治疗的百分比？

数据集(mus):

litium  group   treatment   day
0.009439528 1   Control day1
0.005115057 1   Control day1
0.009742297 1   Control day1
0.016515625 2   Control day1
0.01074537  2   Control day1
0.016300836 2   Control day1 …

我正在尝试使用 ggplot2 在 R 中的条形图上绘制误差条。条形的位置没问题，但是误差条未对齐、重叠。请看下面的例子：

library(ggplot2)

df = structure(list(variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 
4L, 4L), .Label = c("Stage1", "Stage2", "Stage3", "Stage4"), class = "factor"), 
    scenario = c("A", "A", "A", "B", "B", 
    "B", "A", "A", "A", "B", "B", 
    "B", "A", "A", "A", "B", "B", 
    "B", "A", "A", "A", "B", "B", 
    "B"), Period = c("2011-2040", "2041-2070", "2071-2100", 
    "2011-2040", "2041-2070", "2071-2100", "2011-2040", "2041-2070", 
    "2071-2100", …

是否可以仅更改误差线的透明度？使用plt.errorbar()更改的Alpha值会同时影响标记和误差线。

编辑：

就我而言，我有几个不同的数据集，每个值都有其自己的误差，因此我使用来绘制每个数据集plt.errorbar()。这是使用3个不同数据集的MWE：

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x1 = [np.random.uniform(0,10,5)]
x2 = [np.random.uniform(0,10,5)]
x3 = [np.random.uniform(0,10,5)]
y1 = [np.random.uniform(0,10,5)]
y2 = [np.random.uniform(0,10,5)]
y3 = [np.random.uniform(0,10,5)]
err1 = [np.random.uniform(1,2, 5)]
err2 = [np.random.uniform(1,2, 5)]
err3 = [np.random.uniform(1,2, 5)]

plt.errorbar(x1, y1, xerr=err1, yerr=err1, fmt='ro', ms=10)
plt.errorbar(x2, y2, xerr=err2, yerr=err2, fmt='bs', ms=10)
plt.errorbar(x3, y3, xerr=err3, yerr=err3, fmt='g^', ms=10)
plt.show()

我想+facet_grid(.~sample,scales = "free_x")在我的代码的最后一行强制刻面，但结果看起来很不美观（参见图 2）（以我的拙见）。我想知道是否有一种方法可以为 geom_histogram 的每个条形强制特定大小，以便无论组是否平衡，条形在组之间看起来都一样。

谢谢，薇薇安

样本数据 ：

samplenote  prod    N   mean    sd  se  sampleprod  sample
Sample A    PRODUCT A   3   0.562103162 0.120039901 0.069305069 Sample A PRODUCT A  Sample A
Sample A    PRODUCT B   3   0.516322045 0.039250354 0.022661203 Sample A PRODUCT B  Sample A
Sample B    PRODUCT A   3   0.504789098 0.055005623 0.031757511 Sample B PRODUCT A  Sample B
Sample B    PRODUCT B   3   0.564334594 0.035685751 0.020603178 Sample B PRODUCT B  Sample B
Sample C    PRODUCT A   3 …

我使用 pythonerrorbar绘制了一个图，但是参数markersize只能是标量而不是数组，这意味着所有数据点都具有相同的标记大小。我想知道如何markersize为不同的数据点分配不同的值？

ax.errorbar(x,y,xerr=[xlow,xup],yerr=[ylow,yup],color='r',ls='None',marker='o',markersize=5.)

如果我将标记大小创建为5.0*y，我该如何使其工作？

大家好，

我输入数据为：

x(1),y(2),z(2)

x(2),y(2),z(2)

等等，

其中 x 和 y 值分别位于 x 轴和 y 轴上，z 值是误差线。从 Gnuplot 中，我如何重现图中多个图的误差条是透明的？

任何的想法？谢谢！

我试图用 Matplotlib 绘制误差条，就像附加的图形一样，我做不到，有什么建议吗？

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

Media   = data["Media"]
Periodo = data["Periodo"]
P10th     = data["P10th"]
P90th     = data["P90th"]
ind = np.arange(N)    # the x locations for the groups

width = 0.35       # the width of the bars: can also be len(x) sequence

fig, ax = plt.subplots()

ax.errorbar(Media, P90th, P10th, color='red', ls='--', marker='o', capsize=5, capthick=1, ecolor='black')
plt.xticks(ind, ('1910-1940', '1950-1990', '1990-2000', '2001-2010') )
ax.set_ylim(ylims)

，请你帮帮我。

这是我的输出