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使用devtools :: install_git从Gitlab安装非公共包

我的机构最近为我们安装了GitLab.我已经想出如何使用GitLab服务器安装R软件包,devtools::install_git只要项目是公共的,它就可以工作.

#* When modeltable project has Public status
devtools::install_git('https://mini-me2.lerner.ccf.org/nutterb/modeltable.git')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

但是,如果我有一个列为"内部"或"私有"的软件包,我无法在没有某种形式的身份验证的情况下安装软件包.到目前为止,我还没有想出如何通过URL传递身份验证.有没有人有从GitLab下载包的经验?

#* After changing the 'modeltable' project to Private status
devtools::install_git('https://mini-me2.lerner.ccf.org/nutterb/modeltable.git')
Preparing installation of modeltable using the Git-URL: https://mini-me2.lerner.ccf.org/nutterb/modeltable.git
'/usr/bin/git'clone --depth 1 --no-hardlinks https://mini-me2.lerner.ccf.org/nutterb/modeltable.git /tmp/Rtmp5aj1cU/file24493dc03a32
Error: There seems to be a problem retrieving this Git-URL.
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r devtools gitlab

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如何管理R中的多个包位置(文件夹)?

在升级到R-2.14之前,我想借此机会合理化已安装软件包的文件夹结构.

目前我使用R默认值,即所有新安装的软件包都转到R_LIBS_USER.但是,我真的区分了两类包:

  • 包我用反复做我的工作,例如plyr,data.table等等.
  • 我安装的软件包只是为了试验(通常在StackOverflow上复制一个问题或答案)

由于install.packages提供了一个指定lib参数的选项,这显然是可能的.

是否有一种简单的方法来管理包位置,例如通过在.RProfile或中创建一些合理的设置/包装函数RProfile.Site

installation r package

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ggplot传奇在顶部但在标题下面?

有没有办法让ggplot将传奇放在顶部但在标题下面?

举个例子...

在此输入图像描述

..使用以下代码生成:

carrots<-list(Yield=c(345,226,74,559,288,194), 
              Field=c("A","B","C","D","E","F"), 
              Breed=rep(c("Long","Short"),each=3)) 
carrots<-data.frame(carrots) 

ggplot(carrots,aes(y=Yield,x=Field,fill=Breed)) + 
  geom_bar() + 
  opts(title="Title",
       legend.direction = "horizontal", 
       legend.position = "top") + 
         labs(fill="") 
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任何建议将不胜感激?

r ggplot2

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从github安装R包时出错:找不到构建data.table所需的构建工具

从RStudio内部我试图按照这些说明从github安装data.table包,并且包似乎下载没有问题:

> library(devtools)
> dev_mode(on=T)
Dev mode: ON
d> install_github("Rdatatable/data.table")
Downloading GitHub repo Rdatatable/data.table@master
from URL https://api.github.com/repos/Rdatatable/data.table/zipball/master
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然后我收到以下提示:

从源代码构建R包需要安装其他构建工具.您想立即安装其他工具吗?

选择"是"会导致出现此错误消息:

Error: Could not find build tools necessary to build data.table
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考虑到这可能是一个RStudio问题,我尝试在标准R控制台中安装软件包,但这也导致了一个错误:

Downloading GitHub repo Rdatatable/data.table@master
from URL https://api.github.com/repos/Rdatatable/data.table/zipball/master
Installing data.table
"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.0/bin/x64/R" --no-site-file --no-environ --no-save  \
  --no-restore --quiet CMD INSTALL  \
  "C:/Users/Robert/AppData/Local/Temp/RtmpOOKOKu/devtools246832c52ab/Rdatatable-data.table-4348ff4"  \
  --library="C:/Users/Robert/Documents/R-dev" --install-tests 

* installing *source* package 'data.table' ...
** libs
c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.0/include" -DNDEBUG     -I"d:/Compiler/gcc-4.9.3/local330/include"  -fopenmp   -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=core2 -c assign.c -o assign.o
c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc: not found …
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r devtools

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升级所有标准包,同时保留非标准包

有时 GNU R 有一个问题,Hadley Wickham建议

我建议您重新安装所有软件包。

问题是如何以最好的方式做到这一点。我知道install.packagesupdate.packages将升级所有软件包版本并覆盖现有版本

update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)
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使用 CRAN 包时(GitHub 或其他来源没有什么特别之处),这种天真的方法对我有用:

my.packages <- rownames(installed.packages());
install.packages(my.packages);
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例如,如果我从 GitHub 安装了开发版本,或者使用了一些未公开共享的本地包,我该怎么办?

我正在寻找的是一种方法:

  1. 检查新安装(升级/降级)导致的软件包更改;
  2. 从同一来源再次安装软件包;和
  3. 备份我的旧包文件夹。

我该如何满足这些要求?

customization r upgrade cran

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Openxlsx 多重验证损坏输出文件

我正在尝试添加多个验证并将公式添加到 Excel 文件。这是我使用的代码:

library(openxlsx)
fileTemplate <- 'New01.xlsx'
wbTemplate <- loadWorkbook(fileTemplate)
addWorksheet(wbTemplate, "Sheet1")
writeData(wbTemplate, "Sheet1", dataset)
len <- NROW(dataset)
dataValidation(wbTemplate, 2, col = 2, rows = 2:len, type = "list", value = "'Data Validation'!$A$2:$A$19")
dataValidation(wbTemplate, 2, col = 3, rows = 2:len, type = "list", value = "'Data Validation'!$B$2:$B$501")
dataValidation(wbTemplate, 2, col = 5, rows = 2:len, type = "list", value = "'Data Validation'!$C$2:$C$6")
openXL(wbTemplate)
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如果我只使用一个 dataValidation,它会打开,如果不止一个,它会抱怨文件已损坏......

r

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当我安装ggp​​lot2的开发版本时会发生什么

安装ggp​​lot2的开发版是否会覆盖常规版本?我需要一个特定包的开发版本,但我不想搞砸我的东西.我可以卸载开发或者只是重新安装常规版本,然后将覆盖开发版本.我用Google搜索,一无所获.谢谢

r ggplot2 r-package

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