我有一个模拟,有一个巨大的聚合,并在中间组合步骤.我使用plyr的ddply()函数对这个过程进行了原型设计,这对我的大部分需求非常有用.但是我需要这个聚合步骤更快,因为我必须运行10K模拟.我已经在并行缩放模拟,但如果这一步更快,我可以大大减少我需要的节点数量.
这是对我要做的事情的合理简化:
library(Hmisc)
# Set up some example data
year <- sample(1970:2008, 1e6, rep=T)
state <- sample(1:50, 1e6, rep=T)
group1 <- sample(1:6, 1e6, rep=T)
group2 <- sample(1:3, 1e6, rep=T)
myFact <- rnorm(100, 15, 1e6)
weights <- rnorm(1e6)
myDF <- data.frame(year, state, group1, group2, myFact, weights)
# this is the step I want to make faster
system.time(aggregateDF <- ddply(myDF, c("year", "state", "group1", "group2"),
function(df) wtd.mean(df$myFact, weights=df$weights)
)
)
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假设我有列C1,...,CN和函数f,它接受这个数据帧作为参数的列的数据帧.如何将f应用于数据帧的每一行以获得新的数据帧?
例如,
x = data.frame(letter=c('a','b','c'), number=c(1,2,3))
# x is
# letter | number
# a | 1
# b | 2
# c | 3
f = function(letter, number) { paste(letter, number, sep='') }
# desired output is
# a1
# b2
# c3
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我该怎么做呢?我猜它是{s,l,t}应用(x,f)的东西,但我无法弄明白.