相关疑难解决方法(0)

我正在尝试使用Imports:而不是Depends:在DESCRIPTION我的软件包的文件中,但我仍然觉得我还有更多要了解的内容;-)

我从这篇文章中学到的东西(顺便说一下:真棒!!!)就是说我的包装,比如通过环境中的生命而不是附加到搜索路径来mypkg导入(说imported.pkg).当试图找到那些船时,R在遍历搜索列表之前查看.到现在为止还挺好.Imports:imports:mypkgfooimported.pkgimports:mypkg

实际问题

如果imported.pkg(导入mypkg)取决于某个其他包(在Depends:包的DESCRIPTION文件部分中说明),我是否需要使这个包非常Depends:依赖我的包,以便R找到该包的功能？所以在我看来,其他R抱怨.

证据

似乎只是导入这样的包是不够的.例如,拿包roxygen2(CRAN).这取决于digest导入一堆其他包时.我(连同其导入digest的mypkg也需要它),并检查环境imports:mypkg这确实列出了digest函数:"digest" %in% parent.env(asNamespace("mypkg"))返回TRUE

然而,当roxygenize()从作为其中一部分的函数内部运行时mypkg,R抱怨它无法找到digest.

如果您有一个新的R会话（除了来自基础的软件包，没有附加任何软件包），并尝试创建按yearmon类排序的以下xts对象...

df <- data.frame(date = zoo::as.yearmon(seq.Date(as.Date("2015-01-01"),
                                                 as.Date("2015-12-31"),
                                                 by = "month")),
                 num = rnorm(12, 0, 1))

dates <- df[,1]

xts::xts(as.matrix(df[, -1]), order.by = dates)

您得到以下错误。

我以为我了解R名称空间框架，但是在这种情况下我完全迷失了。当dates对象已经是yearmon对象时，为什么xts尝试调用as.yearmon函数？我知道xts取决于动物园，但这是原因吗？

如果连接了动物园，那么错误当然会消失。

我对此问题感兴趣的原因是，我正在创建一个使用xts包的包。我的函数之一返回一个xts对象，但是我希望我的包仅依赖R并导入所有其他包-据哈德利·威克姆（Hadley Wickham）所述，这是最佳实践（据我所知）。但是，由于这个问题，我需要依赖Zoo软件包才能完成这项工作。

我确定我会忽略某些事情，所以我希望SO的一个友好的人能够帮助解释这个问题并提出解决方案。谢谢！

我用来neuralnet训练神经网络。该包，更具体地说是 的绘图功能neuralnet，依赖于grid，它是去年以来的基础包。但是，除非我grid手动加载，否则绘图会失败：

AND <- c(rep(0,7),1)
OR <- c(0,rep(1,7))
binary.data <- data.frame(expand.grid(c(0,1), c(0,1), c(0,1)), AND, OR)
net <- neuralnet::neuralnet(AND + OR ~ Var1 + Var2 + Var3, binary.data, 
                       hidden = 0, linear.output=FALSE)

if(requireNamespace("grid")) {
  neuralnet::plot.nn(net)
}

> Error in plot.nn(net, rep = i, x.entry, x.out, radius, arrow.length, intercept,  : 
> could not find function "grid.newpage"

使用library(grid)帮助，但我想避免这种情况，因为我想稍后在我自己的包中使用它。R 包建议使用requireNamespace，但这也没有帮助，正如我们在上面看到的。

grid::在对函数的所有调用前面添加grid并从源代码构建包解决了这个问题，但我想知道：这是预期的行为吗？查看 的来源neuralnet，我发现没有提及requireNamespace或library …

我坚持定义S3方法autoplot.

我有以下(完整代码在这里):

#' Autoplot for bigobenchmark object
#'
#' @importFrom ggplot2 autoplot
#'
#' @param object
#'
#' @return A ggplot2 plot
#' @export
#'
#' @examples
#' # Create plot for benchmarks
#' library(ggplot2)
#' bench <- bigobenchmark(1:n, for(i in 1:n) for(i in 1:n) 1:n, args=seq(from=1, to=100, length.out = 50))
#' autoplot(bench)
autoplot.bigobenchmark <- function(object) {
  plt <- ggplot2::ggplot(data = object$benchmarks, ggplot2::aes(x=arg, y=mean, colour=expr))
  plt <- plt + ggplot2::geom_line()
  plt <- plt + ggplot2::geom_pointrange(aes(ymin=min, ymax=max)) …

我一直在网上搜索,但找不到快速的答案.我在哪里放置我的包需要的库,以便在加载我的包时也加载它们？

据我了解,文件中的imports参数DESCRIPTION只会在系统当前不存在的情况下安装这些软件包.但是library(ggplot2)在一个包中写入的解决方案是什么,或者我应该为每个脚本分别编写它？

当我在一个新的R会话中写入devtools::load_all()并加载我的包时,我的包依次加载的库都没有被加载.

当我在 RI 中使用一个包时，安装它并在加载它时使用它。现在如果我添加一个使用另一个包的包怎么办？这个包也是自动下载和加载的吗？还是一般禁止 R 包使用另一个包？我不这么认为。

假设我想发布一个 R 包。在我的代码中，我可以使用其他包中的函数并安装和加载这些包吗？或者当我需要来自其他包的函数时这是如何工作的？我是否必须实现一条消息，表明需要这个和那个包，并且用户必须在它之前安装和加载它，并且我需要实现错误捕获功能，以防在 PC 系统上找不到包？

当我想发布一个 R 包时，我可以在我的包/代码中使用/调用 Java 代码吗？

对于已经发布的包——所以让我们以 fGarch 包为例——我想看看完整的代码。我怎么能看到这个？我知道 R 是开源的，我认为或多或少可能只输入一个空函数并显示代码，但有时这不起作用，尤其是我的问题是：有没有办法可以查看整个包的代码？

对于已经发布的包，是否可以查看和查看所有提交的文件？因此，就像提交所有文件的 git 存储库一样 - 代码本身以及需要的其他文件（如描述文件或其他文件） - 我可以看到这些文件并查看它们吗？

此外，关于此处的这篇文章和隐藏功能：在 R 包中是否有我无法作为最终用户看到的代码？这也是指我之前的问题，我如何或通过哪种方式可以看到 R 包中的整个代码？