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安德鲁·格尔曼(Andrew Gelman)最近对R缺乏一个简单的升级过程感到遗憾(可能在Windows上比Linux更相关).有没有人有一个很好的技巧来进行升级,从安装软件到复制所有设置/包？

这个建议包含在评论中,是我最近一直在使用的.首先安装新版本,然后在旧版本中运行:

#--run in the old version of R
setwd("C:/Temp/")
packages <- installed.packages()[,"Package"]
save(packages, file="Rpackages")

在新版本中遵循以下内容:

#--run in the new version
setwd("C:/Temp/")
load("Rpackages")
for (p in setdiff(packages, installed.packages()[,"Package"]))
install.packages(p)

我正在尝试遵循此处和此处的建议，以更新 R 查找已安装软件包的位置。.Library.site我已更新文件中的变量/etc/R/Rprofile.site以包含预期 R 包库目录的位置：

Sys.setenv(".Library.site" = "~/AppData/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/") 

但是，当我启动 R 并执行操作时，该.libPaths()位置不会附加到库位置列表中。为什么？

我试图让R忽略c：\ users \ name \ documents并完全独立/可移植

这是我的目录结构：

.../R/R-2.1.2.2/...
.../R/r_user/
.../R/libs_site/

我更新了Rprofile.site如下：

# Set the working directory
setwd( file.path( R.home() , ".." , "r_user" ) )

# set the home directory
Sys.setenv(HOME=file.path( R.home() , ".." , "r_user" )  )

# Set the site library folder
.Library.site = file.path( R.home() , ".." , "libs_site" )

当R启动时，我运行.libPaths（），但仍然看到c：/ users / ...

因此，也许R不是按照上面的Sys.setenv更新？解决方案？