相关疑难解决方法(0)

自 Big Sur 以来，安装需要在 macOS 中编译的 R 包已被破坏。这是一个这样的例子。

> install.packages('nlme')

  There is a binary version available but the source version is later:
      binary  source needs_compilation
nlme 3.1-150 3.1-151              TRUE

Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/cancel) Yes
installing the source package ‘nlme’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/nlme_3.1-151.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 805592 bytes (786 KB)
==================================================
downloaded 786 KB

* installing *source* package ‘nlme’ ...
** package ‘nlme’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using …

我希望使我的操作系统、R 和 R 软件包保持最新。我不知不觉地升级到 OSX 10.15.6 并升级到 R 4.0.2，陷入了深渊。目前，Rcpp无法编译 C++ 代码，我认为这会导致某些软件包的 CRAN 安装失败（例如glmmTMB），并且还会导致从源安装失败。我将描述我所做的事情，希望有人能够阐明解决方案。

粗略地说，这就是我所做的：

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1. 已安装 OSX 10.15.6
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我不记得日期了，但那是最近的事。我不知道这与问题有多密切相关，我在安装之前rstan需要的其他 R 软件包（例如）时遇到问题。Rcpp

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2. glmmTMB尝试运行一些旧模型时遇到问题
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确切的错误与此问题相同。我遵循了该线程上的各种解决方案，但无济于事。也许最令人沮丧的是当尝试从源代码安装时，它无法编译一些 C++。

这不是我第一次看到类似的错误。当我尝试安装时发生了类似的情况，因此我在类似问题rstan下向他们的存储库寻求一些帮助。没有任何帮助。

这是 R 3.6 上的，所以我想也许值得更新 R 和glmmTMB. 在执行此操作之前，我想安装 Xcode，而不仅仅是安装命令行开发工具，希望安装后能够确保我能将与 clang 和 c++ 编译器相关的所有内容都解决掉。

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3. 安装了 Xcode 以帮助设置基线 C++ 环境
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相对轻松，我能够构建和编译相当简单的 C++ 项目。

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4. 已安装 R 4.0.2
\n …